RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 SGK1O00141 431 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 LEFTY2O00292 366 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 STK25O00506 426 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 AP3D1O14617 1153 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 NRP1O14786 923 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 CLOCKO15516 846 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 RAD21O60216 631 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 SPINK4O60575 86 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 TSPAN2O60636 221 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 PRAMEF2O60811 474 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 SPAG6O75602 509 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 GLCEO94923 617 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 NDUFA7O95182 113 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 GLP2RO95838 553 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 GH2P01242 217 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 CHRNGP07510 517 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 ALPIP09923 528 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 FTH1P19P0C7X4 201 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF735P0CB33 412 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF286BP0CG31 522 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 PPIAL4GP0DN37 164 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 SKILP12757 684 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 LCP1P13796 627 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 HOXB2P14652 356 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 ITIH1P19827 911 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 CD247P20963 164 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 CPN2P22792 545 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 SLC6A2P23975 617 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 ADH6P28332 368 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 SLC6A6P31641 620 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 BRS3P32247 399 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 SHMT1P34896 483 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 ACTN2P35609 894 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 CHKAP35790 457 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 SERPINF1P36955 418 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 SPINT3P49223 89 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 BLKP51451 505 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 TPMTP51580 245 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 RAD23AP54725 363 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 NPC2P61916 151 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 HOXC5Q00444 222 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 SORDQ00796 357 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC15Q0P6D6 951 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 WASHC5Q12768 1159 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 ECH1Q13011 328 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 AQP6Q13520 282 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 CCNIQ14094 377 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 SLC17A1Q14916 467 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 SART3Q15020 963 aaKnown RBP-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 PLCL1Q15111 1095 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF726P1Q15940 193 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 INAQ16352 499 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 RTN1Q16799 776 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 INSCQ1MX18 579 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 ADPRMQ3LIE5 342 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 SYT14P1Q58G82 188 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 YIF1BQ5BJH7 314 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 LINC01556Q5JQF7 62 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 THEM4Q5T1C6 240 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 AGBL4Q5VU57 503 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 CES4AQ5XG92 561 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 TRIM40Q6P9F5 258 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 LRRN1Q6UXK5 716 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 SDIM1Q6ZPB5 146 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 ANKS3Q6ZW76 656 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 C1orf186Q6ZWK4 172 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 COX15Q7KZN9 410 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 SSX6Q7RTT6 188 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM110Q86TL2 294 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 ECHDC2Q86YB7 292 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 GPIHBP1Q8IV16 184 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 RIMKLAQ8IXN7 391 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 C7orf61Q8IZ16 206 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 ANKFN1Q8N957 763 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 DNAAF1Q8NEP3 725 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 NUP35Q8NFH5 326 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 OR7D4Q8NG98 312 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 OR4F17Q8NGA8 305 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 OR4D9Q8NGE8 314 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 OR8B12Q8NGG6 310 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 ABHD4Q8TB40 342 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 C22orf15Q8WYQ4 148 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 MAFIPQ8WZ33 124 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 KIFAP3Q92845 792 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 DNASE1L2Q92874 299 aa-2.25□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP-2.25□□□□□ -2.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms