RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 M0R129 80 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 SYT5O00445 386 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 KIAA0513O60268 411 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 ADAM23O75077 832 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 HSMCR30P0CW71 290 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 ACADMP11310 421 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 IRF4Q15306 451 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 C1orf94Q6P1W5 598 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 XAGE5Q8WWM1 108 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 PRRC1Q96M27 445 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 OPALINQ96PE5 141 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 FNDC11Q9BVV2 318 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 BTBD1Q9H0C5 482 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 C5AR2Q9P296 337 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 COL4A2P08572 1712 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 CCDC88CQ9P219 2028 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 IRGMA1A4Y4 181 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 ASNA1O43681 348 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 NME6O75414 186 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 SPHARQ15513 63 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 SSX1Q16384 188 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 ZNF793Q6ZN11 406 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 NANOGP1Q8N7R0 232 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 OR2L5Q8NG80 312 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 MS4A6EQ96DS6 147 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 C17orf62Q9BQA9 187 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 AICDAQ9GZX7 198 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 PRDM7Q9NQW5 492 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 H3BN98 237 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 HAT1O14929 419 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 NARSO43776 548 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 FHP07954 510 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 CD72P21854 359 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.185e-8■■■□□ 15.7
PMS1-205ENST00000409985 HYAL2Q12891 473 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 CEBPEQ15744 281 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 ABHD17CQ6PCB6 329 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 PODNL1Q6PEZ8 512 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 CCDC190Q86UF4 302 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 PARP16Q8N5Y8 322 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 AMER3Q8N944 861 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 FLCNQ8NFG4 579 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 IL4I1Q96RQ9 567 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 HHATLQ9HCP6 504 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 ANKMY1Q9P2S6 941 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 SNX11Q9Y5W9 270 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 FAM227AF5H4B4 570 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 ADRA2AP08913 450 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 ACP5P13686 325 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 BCL6P41182 706 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 COPZ1P61923 177 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 RPS21P63220 83 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 EFNB1P98172 346 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 CDK5Q00535 292 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 ZNF91Q05481 1191 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 DNASE1L3Q13609 305 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 ADCK2Q7Z695 626 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 SNX29P2Q8IUI4 249 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 FAM131CQ96AQ9 280 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 NRTNQ99748 197 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 CCDC32Q9BV29 185 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD19PQ9H560 264 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 CALML5Q9NZT1 146 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 TRPC4Q9UBN4 977 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 TRAPPC4Q9Y296 219 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 AQP9O43315 295 aa22.39■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 TIE1P35590 1138 aa22.39■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 PCYT1AP49585 367 aa22.39■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 SLAMF1Q13291 335 aa22.39■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 C1DQ13901 141 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 MRGPREQ86SM8 312 aa22.39■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 HDDC3Q8N4P3 179 aa22.39■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 MORN4Q8NDC4 146 aa22.39■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 LIPT1Q9Y234 373 aa22.39■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 OR1A2Q9Y585 309 aa22.39■■□□□ 1.18
PMS1-205ENST00000409985 TRPM6Q9BX84 2022 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 APODP05090 189 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 IFNGR2P38484 337 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 GIPRP48546 466 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 PRR5P85299 388 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 UAP1L1Q3KQV9 507 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SPANXN2Q5MJ10 180 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 STEAP3Q658P3 488 aa22.39■■□□□ 1.17
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