RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 MGAT2Q10469 447 aa25.49■■□□□ 1.67
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ANKRD54-203ENST00000407117 MMP21Q8N119 569 aa25.49■■□□□ 1.67
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ANKRD54-203ENST00000407117 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
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ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF681Q96N22 645 aa25.48■■□□□ 1.67
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ANKRD54-203ENST00000407117 SLC6A15Q9H2J7 730 aa25.45■■□□□ 1.66
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ANKRD54-203ENST00000407117 DCHS2Q6V1P9 2916 aa25.44■■□□□ 1.66
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ANKRD54-203ENST00000407117 PPM1BO75688 479 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-203ENST00000407117 TOXO94900 526 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-203ENST00000407117 CBX7O95931 251 aa25.44■■□□□ 1.66
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ANKRD54-203ENST00000407117 MYL2P10916 166 aa25.44■■□□□ 1.66
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ANKRD54-203ENST00000407117 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-203ENST00000407117 MASP1P48740 699 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-203ENST00000407117 RAE1P78406 368 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-203ENST00000407117 DUSP2Q05923 314 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-203ENST00000407117 TFF3Q07654 80 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-203ENST00000407117 DUSP8Q13202 625 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-203ENST00000407117 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-203ENST00000407117 CCDC153Q494R4 210 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-203ENST00000407117 SH2D5Q6ZV89 423 aa25.44■■□□□ 1.66
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