RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400436.6

SNHG11-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, humanhuman

TSL 2

Gene SNHG11, Length 2,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG11-202ENST00000400436 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNHG11-202ENST00000400436 APEX1P27695 318 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNHG11-202ENST00000400436 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNHG11-202ENST00000400436 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNHG11-202ENST00000400436 NDUFA5Q16718 116 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG11-202ENST00000400436 PDZD3Q86UT5 571 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG11-202ENST00000400436 KIF18BQ86Y91 864 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG11-202ENST00000400436 OR2L2Q8NH16 312 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG11-202ENST00000400436 OTULINQ96BN8 352 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG11-202ENST00000400436 RNFT2Q96EX2 444 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG11-202ENST00000400436 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNHG11-202ENST00000400436 SLX1AQ9BQ83 275 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG11-202ENST00000400436 AIF1LQ9BQI0 150 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG11-202ENST00000400436 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG11-202ENST00000400436 XKR8Q9H6D3 395 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG11-202ENST00000400436 NEUROD4Q9HD90 331 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG11-202ENST00000400436 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG11-202ENST00000400436 P2RX2Q9UBL9 471 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG11-202ENST00000400436 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG11-202ENST00000400436 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.65□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 PRRT4C9JH25 899 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 GPAT3Q53EU6 434 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 LCTLQ6UWM7 567 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 NRSN1Q8IZ57 195 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 TBC1D19Q8N5T2 526 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 SETD6Q8TBK2 473 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 ZG16BQ96DA0 208 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 TMED9Q9BVK6 235 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 LGR4Q9BXB1 951 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 GLIPR2Q9H4G4 154 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 RMI1Q9H9A7 625 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 DKK3Q9UBP4 350 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 SNX7Q9UNH6 387 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 SCAMP1O15126 338 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 CXCR2P25025 360 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 ITGB8P26012 769 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 OCLNQ16625 522 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 B3GLCTQ6Y288 498 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 DTX3Q8N9I9 347 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 C16orf58Q96GQ5 468 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 KCTD7Q96MP8 289 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 DPH7Q9BTV6 452 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 KATNB1Q9BVA0 655 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 SLC22A4Q9H015 551 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 A0A0B4J293 547 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 RGS13O14921 159 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 NDUFS4O43181 175 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 PCCBP05166 539 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 CHRM4P08173 479 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 KELP23276 732 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 ITGB7P26010 798 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 SSR2P43308 183 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 SLC6A11P48066 632 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 WNT4P56705 351 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 FABP5Q01469 135 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 DHCR24Q15392 516 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 ZNF77Q15935 545 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 AMZ2Q86W34 360 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 NUDT13Q86X67 352 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 RNF31Q96EP0 1072 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 CAPNS2Q96L46 248 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 RNF208Q9H0X6 261 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 KLHL31Q9H511 634 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 NTNG1Q9Y2I2 539 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 B4DXG7 233 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 LALBAP00709 142 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 NR2F6P10588 404 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG11-202ENST00000400436 CPEP16870 476 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms