RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 EHD3Q9NZN3 535 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 DTX4Q9Y2E6 619 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 CCL27Q9Y4X3 112 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 CACNA1DQ01668 2161 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD33BA6NCL7 494 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ESPNB1AK53 854 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 E9PLN8 166 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 IGHG3P01860 377 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 MAGEA5P43359 124 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 NRG3P56975 720 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF763Q0D2J5 394 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 DUSP8Q13202 625 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ART3Q13508 389 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 RPS6KA2Q15349 733 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 LTB4RQ15722 352 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 PRAMEF20Q5VT98 475 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 CLEC6AQ6EIG7 209 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 XKRXQ6PP77 449 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC116Q8IYX3 515 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 SIMC1Q8NDZ2 872 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM111AQ96PZ2 611 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 VKORC1Q9BQB6 163 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 BCAP29Q9UHQ4 241 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 NPIPB8E9PQR5 432 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ADAM10O14672 748 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 TP53I11O14683 189 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 AZIN1O14977 448 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 TPOP07202 933 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 AGAP20933 346 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 PRPH2P23942 346 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ALDH3A1P30838 453 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 DCTP40126 519 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 TMED10P49755 219 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 FBXW4P57775 412 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNJ2P63252 427 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF628Q5EBL2 1059 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 RNF165Q6ZSG1 346 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 CD163Q86VB7 1156 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 EID3Q8N140 333 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 OR5M3Q8NGP4 307 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 TCP10LQ8TDR4 215 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ERP27Q96DN0 273 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 DMRTA2Q96SC8 542 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 PFDN4Q9NQP4 134 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 GIMAP4Q9NUV9 329 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC17A7Q9P2U7 560 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 TEX15Q9BXT5 2789 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 NCKAP5O14513 1909 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 FREM3P0C091 2139 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 SPAG7O75391 227 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 PCSK2P16519 638 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 NAGAP17050 411 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 DDCP20711 480 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCD3P28288 659 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 EMDP50402 254 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 SMSP52788 366 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 C2orf80Q0P641 193 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC10A1Q14973 349 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA0040Q15053 153 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 TBCELQ5QJ74 424 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF787Q6DD87 383 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM71E1Q6IPT2 247 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 NOXRED1Q6NXP6 359 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 TRILQ7L0X0 811 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 OR52R1Q8NGF1 315 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 DIO2Q92813 273 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 HSPBAP1Q96EW2 488 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 SMC6Q96SB8 1091 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ITPAQ9BY32 194 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ZFP64Q9NPA5 681 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 MYNNQ9NPC7 610 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 TAS2R7Q9NYW3 318 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 PRODH2Q9UF12 536 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ENTPD4Q9Y227 616 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 HRH3Q9Y5N1 445 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A1B0GVC2 190 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC28A1O00337 649 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 NPHS1O60500 1241 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 FGF4P08620 206 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 MPIP34949 423 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2E3-201ENST00000392415 DCAF7P61962 342 aa18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms