RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 OR52A5Q9H2C5 316 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 ARRDC5A6NEK1 342 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 H7BY64 318 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 SLC28A2O43868 658 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 VEGFDO43915 354 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 TSPAN9O75954 239 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 ADAP00813 363 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 TIMP1P01033 207 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 LINC00271P0C7V0 271 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 SLC6A11P48066 632 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 TATDN3Q17R31 274 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 C9orf64Q5T6V5 341 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 C19orf48Q6RUI8 117 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 CASP12Q6UXS9 341 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF765Q7L2R6 523 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 PDZD3Q86UT5 571 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 ANKRD53Q8N9V6 530 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 PLA2G15Q8NCC3 412 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 PRAP1Q96NZ9 151 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 A4GALTQ9NPC4 353 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 SEMA3GQ9NS98 782 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 SLC23A2Q9UGH3 650 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 KCND3Q9UK17 655 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 SNX11Q9Y5W9 270 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 A0A0G2JN53 185 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 OR5K3A6NET4 321 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 ANHXE9PGG2 379 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 TSC22D2O75157 780 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 C1QBP02746 253 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 H1F0P07305 194 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 PSMB5P28074 263 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 SSTR4P31391 388 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 BSGP35613 385 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 QPRTQ15274 297 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 TCTN3Q6NUS6 607 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 CREB3L2Q70SY1 520 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 CXorf40AQ8TE69 158 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 PPP1R16AQ96I34 528 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 GLTPQ9NZD2 209 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 SEC14L3Q9UDX4 400 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 KLHL21Q9UJP4 597 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 NUP50Q9UKX7 468 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 MGAT4BQ9UQ53 548 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 ALG5Q9Y673 324 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-202ENST00000375175 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 PDE9AO76083 593 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 OR7A10O76100 309 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 ADH1CP00326 375 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 HLA-DMAP28067 261 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 SOX3P41225 446 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 VIPR2P41587 438 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 SLC9A3P48764 834 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 XKP51811 444 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 DPTQ07507 201 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 GPR19Q15760 415 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 C11orf96Q7Z7L8 435 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TMIEQ8NEW7 156 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 ENKURQ8TC29 256 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 POF1BQ8WVV4 589 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 XAGE5Q8WWM1 108 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 KLHL6Q8WZ60 621 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 SMPDL3AQ92484 453 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF607Q96SK3 696 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 MS4A8Q9BY19 250 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 NIPAL2Q9H841 368 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TM7SF3Q9NS93 570 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 REV1Q9UBZ9 1251 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 CLEC2DQ9UHP7 191 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 CMAHPQ9Y471 501 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 NOTCH4Q99466 2003 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 HMGN4O00479 90 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 PLA2G10O15496 165 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 OR1F1O43749 312 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TPST2O60704 377 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 OR12D1P0DN82 309 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TNNI3P19429 210 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 CTNNB1P35222 781 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 CCT3P49368 545 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 CCR8P51685 355 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 ILKQ13418 452 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms