RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 LATS1O95835 1130 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 PRKCGP05129 697 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 GAGE12FP0CL80 117 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 GAGE12GP0CL81 117 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 GAGE12IP0CL82 117 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 RALAP11233 206 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 TNNI1P19237 187 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 PKLRP30613 574 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 MNDAP41218 407 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 SLC6A12P48065 614 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 FMO5P49326 533 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 CSRP3P50461 194 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 TPMTP51580 245 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 NOP14P78316 857 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 GAGE1Q13065 139 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 GAGE4Q13068 117 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 PDZK1IP1Q13113 114 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 PRKAA1Q13131 559 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 KIF19Q2TAC6 998 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 FAM122CQ6P4D5 195 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ARSKQ6UWY0 536 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 KDM7AQ6ZMT4 941 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 MARCH9Q86YJ5 346 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 BBS7Q8IWZ6 715 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 L3MBTL4Q8NA19 623 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 CCDC63Q8NA47 563 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 OR4K1Q8NGD4 311 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 DDI1Q8WTU0 396 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 SMARCD1Q96GM5 515 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 HPDLQ96IR7 371 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ACCSQ96QU6 501 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 GABRG3Q99928 467 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 TRIM9Q9C026 710 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 VN1R1Q9GZP7 353 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 RAB9BQ9NP90 201 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 GDF3Q9NR23 364 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 PIGVQ9NUD9 493 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.62e-8■□□□□ 9.9
CCL20-201ENST00000358813 DONSONQ9NYP3 566 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 COX16Q9P0S2 106 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 GCNT4Q9P109 453 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 TMED3Q9Y3Q3 217 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 FRYQ5TBA9 3013 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ABCA7Q8IZY2 2146 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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CCL20-201ENST00000358813 CACNG3O60359 315 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 OR6A2O95222 327 aa5.05□□□□□ -1.6
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CCL20-201ENST00000358813 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 CDC25AP30304 524 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 SOX6P35712 828 aa5.05□□□□□ -1.6
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CCL20-201ENST00000358813 GLIPR1P48060 266 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 PITPNBP48739 271 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 MTTPP55157 894 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 SLC8A3P57103 927 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 SSTP61278 116 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 PMP22Q01453 160 aa5.05□□□□□ -1.6
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CCL20-201ENST00000358813 LY6DQ14210 128 aa5.05□□□□□ -1.6
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CCL20-201ENST00000358813 PTGR1Q14914 329 aa5.05□□□□□ -1.6
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CCL20-201ENST00000358813 MANEAQ5SRI9 462 aa5.05□□□□□ -1.6
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CCL20-201ENST00000358813 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 GPR141Q7Z602 305 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 AMZ2Q86W34 360 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 PTOV1Q86YD1 416 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 TMEM25Q86YD3 366 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 CROCCP3Q8IVE0 287 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 DAW1Q8N136 415 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 EID2Q8N6I1 236 aa5.05□□□□□ -1.6
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