RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 LRIT3Q3SXY7 679 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 PGBD2Q6P3X8 592 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM92Q6UXU6 159 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 UCN3Q969E3 161 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF607Q96SK3 696 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 CFL2Q9Y281 166 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 KMOO15229 486 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 NDUFS4O43181 175 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 GPX5O75715 221 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 EML2O95834 649 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 SCG5P05408 212 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 SOX6P35712 828 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 GSTM5P46439 218 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 HTR4Q13639 388 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 MLC1Q15049 377 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 MEDAGQ5VYS4 303 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 DEF8Q6ZN54 512 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 SFTPA2Q8IWL1 248 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC01555Q8NAE3 123 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 RASSF5Q8WWW0 418 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 HHATLQ9HCP6 504 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 FGF22Q9HCT0 170 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 TAS2R7Q9NYW3 318 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 ADAM29Q9UKF5 820 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC35G4P0C7Q5 338 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 XKP51811 444 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 TP53BP2Q13625 1128 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CARTPTQ16568 116 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CLIP4Q8N3C7 705 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 AMER3Q8N944 861 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC7A13Q8TCU3 470 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHL6Q8WZ60 621 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB7BQ96AH8 199 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SEMA3GQ9NS98 782 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SEC14L3Q9UDX4 400 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC28A2O43868 658 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 MAGP20916 626 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 NCF4Q15080 339 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SYPL1Q16563 259 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SPANXN2Q5MJ10 180 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 NUDT18Q6ZVK8 323 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 HOXD1Q9GZZ0 328 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 C2orf42Q9NWW7 574 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 A4GNTQ9UNA3 340 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A075B6Q4 140 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 OR1F1O43749 312 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SLITRK5O94991 958 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 TP53P04637 393 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CEACAM5P06731 702 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 COMTD1Q86VU5 262 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 PIK3R3Q92569 461 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SIPA1Q96FS4 1042 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 RIPOR3Q96MK2 946 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC6A18Q96N87 628 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 EHD3Q9NZN3 535 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CLEC2DQ9UHP7 191 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CKAP5Q14008 2032 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 C2CD4DB7Z1M9 353 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 ASNA1O43681 348 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 DYRK3O43781 588 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 OR12D1P0DN82 309 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SMIM11AP58511 58 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF542PQ5EBM4 170 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D19Q8N5T2 526 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM80Q96HE8 168 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 NUAK2Q9H093 628 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 P2RX2Q9UBL9 471 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 H3BN98 237 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 ADH1BP00325 375 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CASP3P42574 277 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 DEFA1P59665 94 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 DEFA3P59666 94 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CSNK1G2P78368 415 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms