RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF81P51508 661 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SYPL1Q16563 259 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 VITQ6UXI7 678 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SLC38A5Q8WUX1 472 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 LTBP1Q14766 1721 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 C1orf105O95561 183 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 IFNA7P01567 189 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SCG5P05408 212 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ACVR2AP27037 513 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 FAM214AQ32MH5 1076 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ACBD7Q8N6N7 88 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 KCT2Q8NC54 265 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 OR8K5Q8NH50 307 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 C1orf216Q8TAB5 229 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 LRIG1Q96JA1 1093 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ARID2Q68CP9 1835 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 PRODHO43272 600 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 PCMT1P22061 227 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 MAN2A2P49641 1150 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 GMFBP60983 142 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 DUSP7Q16829 419 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 CEACAM19Q7Z692 300 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 NUP43Q8NFH3 380 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 CTRCQ99895 268 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 IGFLR1Q9H665 355 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 TGM5O43548 720 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SERPINA3P01011 423 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 FURINP09958 794 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 C6P13671 934 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF3P17036 446 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 BMP8BP34820 402 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 TATDN3Q17R31 274 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 HTR3DQ70Z44 454 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 DPH7Q9BTV6 452 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 INIPQ9NRY2 104 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM202A6NGA9 273 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 IL1AP01583 271 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ACVR1BP36896 505 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 FAHD1Q6P587 224 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SLITRK4Q8IW52 837 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 MFSD4AQ8N468 514 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 CPA6Q8N4T0 437 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 DPF3Q92784 378 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 TANKQ92844 425 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 FKBP10Q96AY3 582 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 GSDMCQ9BYG8 508 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 FKTNO75072 461 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 TOXO94900 526 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 66.6
PTPRU-201ENST00000345512 FAUP35544 74 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SLC6A12P48065 614 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ID2Q02363 134 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 NTRK2Q16620 822 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 FAM26DQ5JW98 314 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 LIPIQ6XZB0 460 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 HDDC3Q8N4P3 179 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 OR51A7Q8NH64 312 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 PSD2Q9BQI7 771 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SNX11Q9Y5W9 270 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 FZD6O60353 706 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 HPGDSO60760 199 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ARL6IP5O75915 188 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 GNSP15586 552 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 PYCR1P32322 319 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 CAPZA2P47755 286 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 TAS2R38P59533 333 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 RPA4Q13156 261 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 NRMQ8IXM6 262 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SNX18Q96RF0 628 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms