RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 CNIH3Q8TBE1 160 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 MS4A4EQ96PG1 132 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 CXorf21Q9HAI6 301 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 PTGFRNQ9P2B2 879 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
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SSR4-201ENST00000320857 TNFRSF10AO00220 468 aa15.95■□□□□ 0.14
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SSR4-201ENST00000320857 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
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SSR4-201ENST00000320857 GIN1Q9NXP7 522 aa15.95■□□□□ 0.14
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SSR4-201ENST00000320857 CDC73Q6P1J9 531 aa15.95■□□□□ 0.14
SSR4-201ENST00000320857 C16orf62Q7Z3J2 963 aa15.95■□□□□ 0.14
SSR4-201ENST00000320857 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa15.95■□□□□ 0.14
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SSR4-201ENST00000320857 RLIMQ9NVW2 624 aa15.95■□□□□ 0.14
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SSR4-201ENST00000320857 BDP1A6H8Y1 2624 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-201ENST00000320857 TMEM221A6NGB7 291 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-201ENST00000320857 K7ESF4 209 aa15.94■□□□□ 0.14
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SSR4-201ENST00000320857 ALPPP05187 535 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-201ENST00000320857 FMO3P31513 532 aa15.94■□□□□ 0.14
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SSR4-201ENST00000320857 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
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SSR4-201ENST00000320857 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa15.94■□□□□ 0.14
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SSR4-201ENST00000320857 MFSD12Q6NUT3 480 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-201ENST00000320857 FAM92BQ6ZTR7 304 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-201ENST00000320857 OR4N5Q8IXE1 308 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-201ENST00000320857 OR2L13Q8N349 312 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-201ENST00000320857 AQP11Q8NBQ7 271 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-201ENST00000320857 C1orf216Q8TAB5 229 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-201ENST00000320857 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
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SSR4-201ENST00000320857 HSPA12BQ96MM6 686 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-201ENST00000320857 SLC38A3Q99624 504 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-201ENST00000320857 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-201ENST00000320857 IER2Q9BTL4 223 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-201ENST00000320857 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SSR4-201ENST00000320857 IL21RQ9HBE5 538 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-201ENST00000320857 ANKHQ9HCJ1 492 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-201ENST00000320857 FAM60AQ9NP50 221 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-201ENST00000320857 ACAD8Q9UKU7 415 aa15.94■□□□□ 0.14
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