RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 SFT2D3Q587I9 215 aa25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 PGM2L1Q6PCE3 622 aa25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR87Q9BY21 358 aa25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD300AQ9UGN4 299 aa25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERVK-19Q9WJR5 959 aa25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTPRBP23467 1997 aa25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDH17O14917 1159 aa25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1QCP02747 245 aa25.59■■□□□ 1.69
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MATN1P21941 496 aa25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAGEA8P43361 318 aa25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRIM2P49643 509 aa25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNASE1L3Q13609 305 aa25.59■■□□□ 1.69
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CTDNEP1-201ENST00000318988 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 FHL5Q5TD97 284 aa25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 SERPINA11Q86U17 422 aa25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL22RA1Q8N6P7 574 aa25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2T12Q8NG77 320 aa25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR52R1Q8NGF1 315 aa25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPATA9Q9BWV2 254 aa25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM117AQ9C073 453 aa25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASCL3Q9NQ33 180 aa25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 DXOO77932 396 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DLSTP36957 453 aa25.58■■□□□ 1.69
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CTDNEP1-201ENST00000318988 COX20Q5RI15 118 aa25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR7G1Q8NGA0 311 aa25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 JADE3Q92613 823 aa25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 NXPE2Q96DL1 559 aa25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXL20Q96IG2 436 aa25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF583Q96ND8 569 aa25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACTRT3Q9BYD9 372 aa25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPATCH2Q9NW75 528 aa25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF639Q9UID6 485 aa25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCFL5Q9UL49 500 aa25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM220BPB1ANY3 271 aa25.58■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRAMEF2O60811 474 aa25.58■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 GMNNO75496 209 aa25.58■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 ETFAP13804 333 aa25.58■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS26P62854 115 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 RTP5Q14D33 572 aa25.58■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM205Q6UW68 189 aa25.58■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM156AQ8NDB6 213 aa25.58■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR8D2Q9GZM6 311 aa25.58■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 COPS7AQ9UBW8 275 aa25.58■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC7A8Q9UHI5 535 aa25.58■■□□□ 1.68
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CBX7O95931 251 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 UMODP07911 640 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 SSTR4P31391 388 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 MVDP53602 400 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 DSTNP60981 165 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 FUT7Q11130 342 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 BNIP2Q12982 314 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAMK2BQ13554 666 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 GCNT6Q5T4J0 391 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM69BQ5VUD6 431 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERICH5Q6P6B1 374 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR155Q7Z3F1 870 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 CALHM3Q86XJ0 350 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 MORN4Q8NDC4 146 aa25.57■■□□□ 1.68
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LPAR4Q99677 370 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 YIPF4Q9BSR8 244 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR51I1Q9H343 314 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCND3Q9UK17 655 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 ELOVL7A1L3X0 281 aa25.56■■□□□ 1.68
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HTR1EP28566 365 aa25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 SOX18P35713 384 aa25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 MFSD12Q6NUT3 480 aa25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa25.56■■□□□ 1.68
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC2A12Q8TD20 617 aa25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAMTS15Q8TE58 950 aa25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 NKD1Q969G9 470 aa25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 C16orf58Q96GQ5 468 aa25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10A5Q9H207 317 aa25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRODH2Q9UF12 536 aa25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa25.55■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa25.55■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 DUXAA6NLW8 204 aa25.55■■□□□ 1.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 HRKO00198 91 aa25.55■■□□□ 1.68
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