RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315554.12

CDC42-201, Transcript of cell division cycle 42, humanhuman

APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42, Length 1,452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-201ENST00000315554 SLC5A8Q8N695 610 aa7.3□□□□□ -1.24
CDC42-201ENST00000315554 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CDC42-201ENST00000315554 OR52R1Q8NGF1 315 aa7.3□□□□□ -1.24
CDC42-201ENST00000315554 WBP1Q96G27 269 aa7.3□□□□□ -1.24
CDC42-201ENST00000315554 FBXL20Q96IG2 436 aa7.3□□□□□ -1.24
CDC42-201ENST00000315554 ZNF354BQ96LW1 612 aa7.3□□□□□ -1.24
CDC42-201ENST00000315554 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CDC42-201ENST00000315554 DPY30Q9C005 99 aa7.3□□□□□ -1.24
CDC42-201ENST00000315554 GLIPR2Q9H4G4 154 aa7.3□□□□□ -1.24
CDC42-201ENST00000315554 EPS8L2Q9H6S3 715 aa7.3□□□□□ -1.24
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CDC42-201ENST00000315554 CGB2Q6NT52 195 aa7.29□□□□□ -1.24
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CDC42-201ENST00000315554 H3F3CQ6NXT2 135 aa7.29□□□□□ -1.24
CDC42-201ENST00000315554 RGS9BPQ6ZS82 235 aa7.29□□□□□ -1.24
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CDC42-201ENST00000315554 LRRC34Q8IZ02 419 aa7.29□□□□□ -1.24
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CDC42-201ENST00000315554 TEX37Q96LM6 180 aa7.29□□□□□ -1.24
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CDC42-201ENST00000315554 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.244e-9■■□□□ 13.6
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CDC42-201ENST00000315554 ASIC5Q9NY37 505 aa7.29□□□□□ -1.24
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CDC42-201ENST00000315554 TEKT2Q9UIF3 430 aa7.29□□□□□ -1.24
CDC42-201ENST00000315554 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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CDC42-201ENST00000315554 SOX3P41225 446 aa7.28□□□□□ -1.24
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CDC42-201ENST00000315554 DGKQP52824 942 aa7.28□□□□□ -1.24
CDC42-201ENST00000315554 MANFP55145 182 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CDC42-201ENST00000315554 FUT7Q11130 342 aa7.28□□□□□ -1.24
CDC42-201ENST00000315554 MAP4K2Q12851 820 aa7.28□□□□□ -1.24
CDC42-201ENST00000315554 TUBA3CQ13748 450 aa7.28□□□□□ -1.24
CDC42-201ENST00000315554 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CDC42-201ENST00000315554 RPS6KA2Q15349 733 aa7.28□□□□□ -1.24
CDC42-201ENST00000315554 CEBPEQ15744 281 aa7.28□□□□□ -1.24
CDC42-201ENST00000315554 SMU1Q2TAY7 513 aa7.28□□□□□ -1.24
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