RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 BCL2L10Q9HD36 194 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 BATF3Q9NR55 127 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SEMA5BQ9P283 1151 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SEC14L3Q9UDX4 400 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SH3GLB1Q9Y371 365 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 MUC3AQ02505 3323 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 A0A087WV62 115 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 H0YIG0 161 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SIGLEC6O43699 453 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 HS6ST1O60243 411 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 OR10H2O60403 315 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 CER1O95813 267 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 IFNW1P05000 195 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 CHRM4P08173 479 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 IFI6P09912 130 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 RRM2P31350 389 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 MAPK10P53779 464 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 KCNC4Q03721 635 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 EPS8Q12929 822 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SLC13A2Q13183 592 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 FAM214AQ32MH5 1076 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 GPAT3Q53EU6 434 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 FHL5Q5TD97 284 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 CDC73Q6P1J9 531 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 C16orf62Q7Z3J2 963 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 NRBF2Q96F24 287 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SLC41A2Q96JW4 573 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 EPYCQ99645 322 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 BTBD2Q9BX70 525 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 EXD2Q9NVH0 621 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 MAT2BQ9NZL9 334 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 LIPT1Q9Y234 373 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ORC6Q9Y5N6 252 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 U3KQA8 63 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CPED1A4D0V7 1026 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 DUXAA6NLW8 204 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 A8MU76 341 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PATE3B3GLJ2 98 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 H0YAE9 185 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PCDHGA12O60330 932 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PLOD3O60568 738 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 DNAJB5O75953 348 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 TNFAIP8O95379 198 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 AGR2O95994 175 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 FESP07332 822 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 GNAO1P09471 354 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 MSL3P1P0C860 447 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SLC35E2P0CK97 266 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ETS2P15036 469 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 MYF6P23409 242 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SPIBQ01892 262 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 LAPTM4AQ15012 233 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 DUSP7Q16829 419 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SYT16Q17RD7 645 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ZNF595Q8IYB9 648 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 FAM181AQ8N9Y4 354 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 GPR32P1Q8NGA4 272 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ADAMTS15Q8TE58 950 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 NAT6Q93015 286 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 FBXL20Q96IG2 436 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ADAP2Q9NPF8 381 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ENAMQ9NRM1 1142 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PNPLA3Q9NST1 481 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CUTCQ9NTM9 273 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CALML5Q9NZT1 146 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 KIF17Q9P2E2 1029 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 C3orf18Q9UK00 162 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 TESMINQ9Y4I5 508 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ENPP4Q9Y6X5 453 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 A0A0G2JPF8 293 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 H3BMH7 237 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CLDN4O14493 209 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CASC3O15234 703 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 NME6O75414 186 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 H6PDO95479 791 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 RECKO95980 971 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms