RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 SCELO95171 688 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR75O95800 540 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PGRP06401 933 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC175P0C221 793 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 SRD5A2P31213 254 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 SOX18P35713 384 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 NEK2P51955 445 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ARFIP1P53367 373 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 CASP9P55211 416 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC37A1P57057 533 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 SIRPAP78324 504 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PSPHP78330 225 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR20EP86478 221 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR20CP86479 221 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR20DP86480 221 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR20BP86481 221 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR20AP86496 221 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFRSF17Q02223 184 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 FUT7Q11130 342 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 SLAMF1Q13291 335 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAM5Q6NVV9 412 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 BEND4Q6ZU67 534 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 GALNT7Q86SF2 657 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR180Q86V85 440 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4N5Q8IXE1 308 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 OR7G1Q8NGA0 311 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.12□□□□□ -1.27
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PGGT1B-201ENST00000296642 CMTM7Q96FZ5 175 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 F2RL3Q96RI0 385 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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PGGT1B-201ENST00000296642 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 VWA7Q9Y334 891 aa7.12□□□□□ -1.27
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PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF175Q9Y473 711 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 OARD1Q9Y530 152 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa7.11□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 NCKAP5O14513 1909 aa7.11□□□□□ -1.27
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PGGT1B-201ENST00000296642 TNFRSF21O75509 655 aa7.11□□□□□ -1.27
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PGGT1B-201ENST00000296642 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
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PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A16P16260 332 aa7.11□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF708P17019 499 aa7.11□□□□□ -1.27
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PGGT1B-201ENST00000296642 KRT20P35900 424 aa7.11□□□□□ -1.27
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PGGT1B-201ENST00000296642 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa7.11□□□□□ -1.27
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PGGT1B-201ENST00000296642 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.11□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.11□□□□□ -1.27
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PGGT1B-201ENST00000296642 CYP20A1Q6UW02 462 aa7.11□□□□□ -1.27
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PGGT1B-201ENST00000296642 EXOC3L1Q86VI1 746 aa7.11□□□□□ -1.27
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PGGT1B-201ENST00000296642 SNX31Q8N9S9 440 aa7.11□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 STEAP2Q8NFT2 490 aa7.11□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 RDH11Q8TC12 318 aa7.11□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 RGMAQ96B86 450 aa7.11□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 CTHRC1Q96CG8 243 aa7.11□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 MARK4Q96L34 752 aa7.11□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa7.11□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.11□□□□□ -1.27
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