RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 FESP07332 822 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 NDUFV2P19404 249 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 CD38P28907 300 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 PIGFQ07326 219 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 CBLBQ13191 982 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 CPZQ66K79 652 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ZNF627Q7L945 461 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 GPR149Q86SP6 731 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 KLHL31Q9H511 634 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 RDH16O75452 317 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 APOL3O95236 402 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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LRP5-201ENST00000294304 CDRT4Q8N9R6 151 aa20.16■□□□□ 0.82
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LRP5-201ENST00000294304 SHHQ15465 462 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 OR5K2Q8NHB8 316 aa20.16■□□□□ 0.82
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LRP5-201ENST00000294304 I3L1I5 382 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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LRP5-201ENST00000294304 GPR4P46093 362 aa20.15■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 RPE65Q16518 533 aa20.15■□□□□ 0.82
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LRP5-201ENST00000294304 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 H3BNC9 293 aa20.15■□□□□ 0.82
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LRP5-201ENST00000294304 DENRO43583 198 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ADORA3P0DMS8 318 aa20.15■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 CELP19835 753 aa20.15■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 PCGF2P35227 344 aa20.15■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 RNF175Q8N4F7 328 aa20.15■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 SLC5A8Q8N695 610 aa20.15■□□□□ 0.82
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LRP5-201ENST00000294304 LSMEM2Q8N112 164 aa20.15■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa20.14■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 TMEM151BQ8IW70 566 aa20.14■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 CREB3L4Q8TEY5 395 aa20.14■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 HDAC8Q9BY41 377 aa20.14■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 LPAL2Q16609 132 aa20.14■□□□□ 0.81
LRP5-201ENST00000294304 CLMPQ9H6B4 373 aa20.14■□□□□ 0.81
LRP5-201ENST00000294304 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.14■□□□□ 0.81
LRP5-201ENST00000294304 H3BSH0 61 aa20.14■□□□□ 0.81
LRP5-201ENST00000294304 SGK494L7N484 410 aa20.14■□□□□ 0.81
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LRP5-201ENST00000294304 STARD5Q9NSY2 213 aa20.14■□□□□ 0.81
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LRP5-201ENST00000294304 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
LRP5-201ENST00000294304 STARP49675 285 aa20.14■□□□□ 0.81
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LRP5-201ENST00000294304 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa20.14■□□□□ 0.81
LRP5-201ENST00000294304 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
LRP5-201ENST00000294304 ZNF101Q8IZC7 436 aa20.14■□□□□ 0.81
LRP5-201ENST00000294304 LRR1Q96L50 414 aa20.14■□□□□ 0.81
LRP5-201ENST00000294304 TTYH2Q9BSA4 534 aa20.14■□□□□ 0.81
LRP5-201ENST00000294304 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa20.14■□□□□ 0.81
LRP5-201ENST00000294304 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
LRP5-201ENST00000294304 IMPA1P29218 277 aa20.13■□□□□ 0.81
LRP5-201ENST00000294304 HLCSP50747 726 aa20.13■□□□□ 0.81
LRP5-201ENST00000294304 ARFRP1Q13795 201 aa20.13■□□□□ 0.81
LRP5-201ENST00000294304 KIAA0895LQ68EN5 471 aa20.13■□□□□ 0.81
LRP5-201ENST00000294304 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa20.13■□□□□ 0.81
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