RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 ACVR2AP27037 513 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 MTSS1LQ765P7 747 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 YIPF6Q96EC8 236 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 WDR92Q96MX6 357 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 LMAN2LQ9H0V9 348 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 A4GNTQ9UNA3 340 aa14.86□□□□□ -0.03
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SLC20A1-201ENST00000272542 NPIPA7E9PJI5 369 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 NPIPA8P0DM63 369 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 GABRG2P18507 467 aa14.86□□□□□ -0.03
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SLC20A1-201ENST00000272542 CXCR4P61073 352 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 NFATC4Q14934 902 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 TIGD6Q17RP2 521 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF425Q6IV72 752 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 IQCHQ86VS3 1027 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 NRROSQ86YC3 692 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 NUP43Q8NFH3 380 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.86□□□□□ -0.03
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SLC20A1-201ENST00000272542 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 TMEM247A6NEH6 219 aa14.85□□□□□ -0.03
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SLC20A1-201ENST00000272542 RUNX2Q13950 521 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 NR1D2Q14995 579 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC48A1Q6P1K1 146 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 TRIM48Q8IWZ4 208 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 TBC1D19Q8N5T2 526 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 TCEANCQ8N8B7 351 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 OR7G2Q8NG99 324 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF607Q96SK3 696 aa14.85□□□□□ -0.03
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SLC20A1-201ENST00000272542 EVA1BQ9NVM1 165 aa14.85□□□□□ -0.03
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SLC20A1-201ENST00000272542 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 ZER1Q7Z7L7 766 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 OR2A14Q96R47 310 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 OR7D2Q96RA2 312 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 NT5DC2Q9H857 520 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 CNIH4Q9P003 139 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 LRRTM2O43300 516 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 SERPINB7O75635 380 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 DBTP11182 482 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 DRD2P14416 443 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 XKP51811 444 aa14.85□□□□□ -0.03
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SLC20A1-201ENST00000272542 PSD4Q8NDX1 1056 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF675Q8TD23 568 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 ELP4Q96EB1 424 aa14.85□□□□□ -0.03
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SLC20A1-201ENST00000272542 TPSD1Q9BZJ3 242 aa14.85□□□□□ -0.03
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SLC20A1-201ENST00000272542 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 ALPK2Q86TB3 2170 aa14.85□□□□□ -0.03
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SLC20A1-201ENST00000272542 CH25HO95992 272 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 UGT2B7P16662 529 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
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SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 PGBD2Q6P3X8 592 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 RNF217Q8TC41 542 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM3CQ92520 227 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 FNDC11Q9BVV2 318 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 EGLN3Q9H6Z9 239 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 FBXO34Q9NWN3 711 aa14.84□□□□□ -0.03
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SLC20A1-201ENST00000272542 FTSJ1Q9UET6 329 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC20A1-201ENST00000272542 FANCMQ8IYD8 2048 aa14.84□□□□□ -0.03
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