RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049404.12

Clasp1-201, Transcript of CLIP-associating protein 1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Clasp1, Length 7,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Upp2Q8CGR7 320 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Sash3Q8K352 380 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Gtf2f2Q8R0A0 249 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Vmn1r185Q8R299 319 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Olfr165Q8VFA2 313 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Cdhr5Q8VHF2 831 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Mthfd1Q922D8 935 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 RTRAFQ9CQE8 244 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 AtrnQ9WU60 1428 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Dmrta2A2A9A2 531 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Nlgn4lB0F2B4 945 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Spdye4cI6XKQ3 339 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Mcpt1P11034 246 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 TyrP11344 533 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 HexbP20060 536 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Clk1P22518 483 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Kcnn3P58391 732 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Kctd21Q3URF8 260 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Slc22a18Q78KK3 406 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Slc35f2Q7TML3 375 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Ska3Q8C263 411 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Trnt1Q8K1J6 434 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Snapc5Q8R2K7 98 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Cxxc1Q9CWW7 660 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Prl2b1Q9DAZ2 228 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Tnfrsf22Q9ER62 198 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Rnf11Q9QYK7 154 aa7.3□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Wfdc16A2A5H4 111 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Gm8127E9Q0P0 100 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Olfr596F8VQ26 312 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Gm8024L7N2E0 100 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 UncxO08934 530 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Zp2P20239 713 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Nat3P50296 290 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 RidaP52760 135 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Vipr1P97751 459 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Nell1Q2VWQ2 810 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Gm5460Q3UQ97 254 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Olfr463Q5SW49 311 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Olfr462Q5SW50 311 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 B4gat1Q8BWP8 415 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Hmgcs1Q8JZK9 520 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Irf2bplQ8K3X4 775 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Ppp1r3gQ9CW07 347 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Arfgap3Q9D8S3 523 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 PmpcaQ9DC61 524 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Tm9sf3Q9ET30 587 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 ApipQ9WVQ5 241 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Slit3Q9WVB4 1523 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Tcrg-C4A0A075B6C7 190 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 CtnsP57757 367 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Mrps6P58064 125 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Commd6Q3V4B5 87 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Map4k2Q61161 821 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Cd53Q61451 219 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Fbxo22Q78JE5 402 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Q8BTG6 205 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Znf574Q8BY46 900 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Slc27a4Q91VE0 643 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 OptcQ920A0 328 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 NenfQ9CQ45 171 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Sppl3Q9CUS9 384 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Vmn1r172Q9EPS4 313 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Tor1bQ9ER41 336 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Ropn1Q9ESG2 212 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Tox2A2A472 547 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Gm10720D3Z1I5 223 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Gm20671F6TVX7 576 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Galnt1O08912 559 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Ercc1P07903 298 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Dsc3P55850 896 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Gstt2Q61133 244 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Runx3Q64131 409 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Vmn1r231Q8R2A3 311 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Klrb1fQ8VD98 217 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Tmem5Q8VDX6 444 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Wdr45Q91VM3 360 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Tpgs1Q99MS8 303 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Adam17Q9Z0F8 827 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 CerklA2AQH1 525 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Phf11A6H5X4 337 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Olfr549E9Q542 316 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Socs5O54928 536 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Asgr2P24721 301 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Ptpn22P29352 802 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Sirt6P59941 334 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 OxtrP97926 388 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Sox14Q04892 240 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Tie1Q06806 1134 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Gm525Q3V3I5 90 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Gm14851Q5ERJ0 116 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Pou4f2Q63934 411 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Ubfd1Q78JW9 368 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Olfr1051Q7TR76 308 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Dupd1Q8BK84 215 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Rnf26Q8BUH7 424 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Ubap2Q91VX2 1132 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Olfr114Q923Q8 312 aa7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Cyb5bQ9CQX2 146 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Clasp1-201ENSMUST00000049404 Tmbim6Q9D2C7 237 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.4 ms