RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	AGAP5	A6NIR3	686 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449		H0YIV9	168 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	RFXAP	O00287	272 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	SLCO2B1	O94956	709 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	GKN3P	P0CG01	181 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	HSD3B1	P14060	373 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	HSD3B2	P26439	372 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	MPI	P34949	423 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	KHK	P50053	298 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	TUBA1B	P68363	451 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	TUBA1A	Q71U36	451 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	COX18	Q8N8Q8	333 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	GATS	Q8NAP1	163 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	KCTD7	Q96MP8	289 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	UPK1B	O75841	260 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	CTSE	P14091	401 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	SDHB	P21912	280 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	MMP12	P39900	470 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	CD97	P48960	835 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	GPM6B	Q13491	265 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	C1orf61	Q13536	156 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	LTB4R	Q15722	352 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	VRK2	Q86Y07	508 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	LAX1	Q8IWV1	398 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	EPYC	Q99645	322 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	SIAE	Q9HAT2	523 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	PLPP1	O14494	284 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	GSTT2	P0CG29	244 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	GSTT2B	P0CG30	244 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	CMPK1	P30085	196 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	SDC2	P34741	201 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	C18orf63	Q68DL7	685 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	KLB	Q86Z14	1044 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	COQ7	Q99807	217 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	STARD5	Q9NSY2	213 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449	WDR45	Q9Y484	360 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449		J3QLW9	94 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	MPZL2	O60487	215 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	KAT7	O95251	611 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	GNS	P15586	552 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF19	P17023	458 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	ACVR1B	P36896	505 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	ERVK-21	P61565	698 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF91	Q05481	1191 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	RBBP4	Q09028	425 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	DPPA4	Q7L190	304 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	NRM	Q8IXM6	262 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	METTL4	Q8N3J2	472 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	FRMD1	Q8N878	549 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	SYT14	Q8NB59	555 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	NUP43	Q8NFH3	380 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	DUSP21	Q9H596	190 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	SP140L	Q9H930	580 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	NEK6	Q9HC98	313 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	OR2A25	A4D2G3	310 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449		A8MUA0	341 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	NTN1	O95631	604 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	GYPB	P06028	91 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	HOXA9	P31269	272 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACSS3-208	ENST00000616449	TNFSF8	P32971	234 aa		12.08	□□□□□ -0.48

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