RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 LAMTOR5O43504 91 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 C1orf105O95561 183 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 DCKP27707 260 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 OR3A3P47888 321 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 OR3A2P47893 321 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 CHAF1BQ13112 559 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 PMS2P3Q13401 168 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGAP19Q14CB8 494 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 IRF4Q15306 451 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 WSCD2Q2TBF2 565 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 AKIRIN2Q53H80 203 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 TOMM5Q8N4H5 51 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 MAU2Q9Y6X3 613 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 ANTXRLA6NF34 631 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 GRXCR2A6NFK2 248 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 C1orf189Q5VU69 101 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 GPAT4Q86UL3 456 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 SNX29P2Q8IUI4 249 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 PHIPQ8WWQ0 1821 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A0G2JPF8 293 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 GABRR3A8MPY1 467 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 NDUFV2P19404 249 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 DDCP20711 480 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 CLCA4Q14CN2 919 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 ADGRG5Q8IZF4 528 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC30A3Q99726 388 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 LTBP4Q8N2S1 1624 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 PPM1BO75688 479 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 VEZF1Q14119 521 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 RUNDC3AQ59EK9 446 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF367Q7RTV3 350 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 ACTRT3Q9BYD9 372 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 ADAP00813 363 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 SELENOWP63302 87 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 HSF2Q03933 536 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 SPHARQ15513 63 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 LSMEM2Q8N112 164 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 LSM1O15116 133 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR143P51810 404 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 HK3P52790 923 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 NSDHLQ15738 373 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 OR5T3Q8NGG3 340 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM236Q5W0B7 351 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 ACOT4Q8N9L9 421 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 TUBA1CQ9BQE3 449 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 ACTR10Q9NZ32 417 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 DKK3Q9UBP4 350 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 PLCL2Q9UPR0 1127 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAJB5O75953 348 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 EN2P19622 333 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 MYF6P23409 242 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 SOX2P48431 317 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM225Q6GV28 225 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 LGALS12Q96DT0 336 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 HS6ST2Q96MM7 605 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 CSN2P05814 226 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 MC3RP41968 323 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 TCTE1Q5JU00 501 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 TANGO2Q6ICL3 276 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC22A16Q86VW1 577 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 C7orf57Q8NEG2 295 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 ADORA3P0DMS8 318 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 PGFP49763 221 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 CDKL1Q00532 357 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM86B1Q8N7N1 296 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 WFDC5Q8TCV5 224 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 USP54Q70EL1 1684 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 M0R3H8 397 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 TP53I11O14683 189 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 MINDY2Q8NBR6 621 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRJ-208ENST00000615445 SPPL3Q8TCT6 385 aa19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms