RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611614.4

COPS7B-223, Transcript of COP9 signalosome subunit 7B, human

TSL 3 BASIC

Gene COPS7B, Length 2,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS7B-223	ENST00000611614	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	AHSA2	Q719I0	299 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	PARG	Q86W56	976 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	COPS4	Q9BT78	406 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	NLN	Q9BYT8	704 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	POLE4	Q9NR33	117 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	TRIO	O75962	3097 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	TBX19	O60806	448 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	DDC	P20711	480 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	ZXDA	P98168	799 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	COLEC12	Q5KU26	742 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	MS4A8	Q9BY19	250 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		13.13	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614		A8MVJ9	347 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	DLGAP3	O95886	979 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	VIP	P01282	170 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	DEFA1	P59665	94 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	DEFA3	P59666	94 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	DSTN	P60981	165 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	FZD2	Q14332	565 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	STEAP3	Q658P3	488 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	LGI4	Q8N135	537 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	NATD1	Q8N6N6	113 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	OR52J3	Q8NH60	311 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	LCN9	Q8WX39	176 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	HAT1	O14929	419 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	PRAMEF10	O60809	474 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	MED26	O95402	600 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	BSG	P35613	385 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	ETV6	P41212	452 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	XCR1	P46094	333 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	CCR8	P51685	355 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	MAPK12	P53778	367 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	REEP5	Q00765	189 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	TIGD6	Q17RP2	521 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	IQCH	Q86VS3	1027 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	HTRA1	Q92743	480 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	F2RL3	Q96RI0	385 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	NRTN	Q99748	197 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	PIP5K1A	Q99755	562 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	XKR8	Q9H6D3	395 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	NT5DC2	Q9H857	520 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	RLIM	Q9NVW2	624 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		13.12	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614		M0R082	166 aa		13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	RGS13	O14921	159 aa		13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	TBX1	O43435	398 aa		13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	CDK1	P06493	297 aa		13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	PKLR	P30613	574 aa		13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	LIPA	P38571	399 aa		13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	CYP4F2	P78329	520 aa		13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	OLR1	P78380	273 aa		13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	SLC13A2	Q13183	592 aa		13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	CRELD1	Q96HD1	420 aa		13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	QRFPR	Q96P65	431 aa		13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	MENT	Q9BUN1	341 aa		13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		13.11	□□□□□ -0.31
COPS7B-223	ENST00000611614	MKLN1	Q9UL63	735 aa		13.11	□□□□□ -0.31

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