RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 CLEC2LP0C7M8 214 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 OCM2P0CE71 109 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PNMTP11086 282 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DAOP14920 347 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF18P17022 549 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CTPS1P17812 591 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 EGR1P18146 543 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GABRB1P18505 474 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ADRA2CP18825 462 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 UGT1A4P22310 534 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GLRA1P23415 457 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 IGFBP5P24593 272 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DPP4P27487 766 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 EPHB2P29323 1055 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 HOXC9P31274 260 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PTGER4P35408 488 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 UGT1A3P35503 534 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 UGT1A5P35504 534 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 AHRP35869 848 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MAP3K8P41279 467 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 BTDP43251 543 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MMP13P45452 471 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NSFP46459 744 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 OR3A3P47888 321 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RAB9AP51151 201 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MMP15P51511 669 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 HK3P52790 923 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 C21orf59P57076 290 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MYL7Q01449 175 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CD69Q07108 199 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PUDPQ08623 228 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MGAT3Q09327 533 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GAGE1Q13065 139 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SLAMF1Q13291 335 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ITGADQ13349 1161 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 IL10RAQ13651 578 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TFDP1Q14186 410 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 HNF4GQ14541 408 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PTPRCAPQ14761 206 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PTGR1Q14914 329 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TRAM2Q15035 370 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SLC9A3R2Q15599 337 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PTGISQ16647 500 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 UGT8Q16880 541 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 EXOC3L4Q17RC7 722 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 BSXQ3C1V8 233 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PTCHD3Q3KNS1 767 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ALKBH6Q3KRA9 238 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 AKIRIN2Q53H80 203 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 C5orf47Q569G3 176 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MTX3Q5HYI7 312 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF691Q5VV52 312 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MEDAGQ5VYS4 303 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 LIPMQ5VYY2 423 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 KRT39Q6A163 491 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TIGD3Q6B0B8 471 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 BRAT1Q6PJG6 821 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FIGLAQ6QHK4 219 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NHLRC1Q6VVB1 395 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GDPD4Q6W3E5 623 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF788Q6ZQV5 615 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DCDC5Q6ZRR9 648 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM26Q6ZUK4 368 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SLC26A11Q86WA9 606 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RBFAQ8N0V3 343 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SPAG16Q8N0X2 631 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MMP21Q8N119 569 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 KIF2BQ8N4N8 673 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GATSQ8NAP1 163 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 C8orf58Q8NAV2 365 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MFSD9Q8NBP5 474 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM116Q8NCL8 245 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC54Q8NEL0 328 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ABHD11Q8NFV4 315 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 STXBP6Q8NFX7 210 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 OR5B17Q8NGF7 314 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 OR5T2Q8NGG2 359 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 OR5T3Q8NGG3 340 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 KCNG3Q8TAE7 436 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D16Q8TBP0 767 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D15Q8TC07 691 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NRG4Q8WWG1 115 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 OIT3Q8WWZ8 545 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SMPDL3AQ92484 453 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SEMA4DQ92854 862 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 STMN2Q93045 179 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ULK4Q96C45 1275 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 C16orf58Q96GQ5 468 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PGAM5Q96HS1 289 aa2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms