RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 TRAF3Q13114 568 aa15.28■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 RASA2Q15283 850 aa15.28■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 SGO1Q5FBB7 561 aa15.28■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 TEX35Q5T0J7 233 aa15.28■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa15.28■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 ACBD4Q8NC06 268 aa15.28■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 OR10G3Q8NGC4 313 aa15.28■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 NEIL3Q8TAT5 605 aa15.28■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa15.28■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 TRPS1Q9UHF7 1281 aa15.28■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 HRH3Q9Y5N1 445 aa15.28■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 HSPB2A8KAH6 182 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 AHRRA9YTQ3 701 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 PGRMC2O15173 223 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 ABHD2P08910 425 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 PSPHP78330 225 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 HSPB2Q16082 182 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 SLC48A1Q6P1K1 146 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 LYPD8Q6UX82 237 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 COMMD6Q7Z4G1 85 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 SLC22A9Q8IVM8 553 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 IFT20Q8IY31 132 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 VWA5B2Q8N398 1253 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 CEP112Q8N8E3 955 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF559Q9BR84 538 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 BRINP2Q9C0B6 783 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 VPS29Q9UBQ0 182 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 PRODH2Q9UF12 536 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 LIPGQ9Y5X9 500 aa15.27■□□□□ 0.04
SPNS1-211ENST00000568829 CACNA1CQ13936 2221 aa15.27■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 NKX2-6A6NCS4 301 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 ACOX3O15254 700 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 TRAPPC6AO75865 159 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 SUPT7LO94864 414 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 TOXO94900 526 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 ESRRBO95718 433 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 ATP1B1P05026 303 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 GLI4P10075 376 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 SSTR4P31391 388 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 NAA20P61599 178 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 CLCQ05315 142 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 TIFABQ6ZNK6 161 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF441Q8N8Z8 693 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 KIF18AQ8NI77 898 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 SPPL2AQ8TCT8 520 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 DCAKDQ8WVC6 231 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 HSPBAP1Q96EW2 488 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 UCK2Q9BZX2 261 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 ZBTB26Q9HCK0 441 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 GIMAP4Q9NUV9 329 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 EDARQ9UNE0 448 aa15.26■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 A8MT66 165 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 DVL2O14641 736 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 ULK1O75385 1050 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 PDYNP01213 254 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 CELA3AP09093 270 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 IGFBP2P18065 325 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 HMOX2P30519 316 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 MAP4K2Q12851 820 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 MYBPHQ13203 477 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 HEPACAMQ14CZ8 416 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 ADGRD1Q6QNK2 874 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 NUP54Q7Z3B4 507 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 CDH24Q86UP0 819 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF615Q8N8J6 731 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 ACMSDQ8TDX5 336 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 KLHL29Q96CT2 875 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 ERP27Q96DN0 273 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC126Q96EE4 140 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 RILPQ96NA2 401 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 ANGPTL4Q9BY76 406 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 METTL7AQ9H8H3 244 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 PFDN4Q9NQP4 134 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 BCAP29Q9UHQ4 241 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa15.25■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 WASHC1A8K0Z3 465 aa15.24■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 H3BQF6 201 aa15.24■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 ZWINTO95229 277 aa15.24■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 GSTA1P08263 222 aa15.24■□□□□ 0.03
SPNS1-211ENST00000568829 DRD2P14416 443 aa15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms