RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	HOXB2	P14652	356 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CBL	P22681	906 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	PCSK6	P29122	969 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	AKT2	P31751	481 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	UGT2B10	P36537	528 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CRYBA2	P53672	197 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SKP1	P63208	163 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	HPCA	P84074	193 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SPIB	Q01892	262 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	DGCR6	Q14129	220 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	DCST1	Q5T197	706 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	LGI4	Q8N135	537 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	COL21A1	Q96P44	957 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	IL17F	Q96PD4	163 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	PINK1	Q9BXM7	581 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	LHPP	Q9H008	270 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CLN6	Q9NWW5	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CBFA2T3	O75081	653 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	AK1	P00568	194 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	NUDT7	P0C024	238 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	OSM	P13725	252 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CTH	P32929	405 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	GPC1	P35052	558 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	IGFALS	P35858	605 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	RABIF	P47224	123 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CCR5	P51681	352 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	MC1R	Q01726	317 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	C2orf27A	Q580R0	203 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	COX20	Q5RI15	118 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	ADCK2	Q7Z695	626 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	FAR1	Q8WVX9	515 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	LCN9	Q8WX39	176 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	MAL2	Q969L2	176 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CHFR	Q96EP1	664 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SERINC2	Q96SA4	455 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	COPS4	Q9BT78	406 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	DPH7	Q9BTV6	452 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	ITPA	Q9BY32	194 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62

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