RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545678.1

RBM7-208, Transcript of RNA binding motif protein 7, human

TSL 3 BASIC

Gene RBM7, Length 867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM7-208	ENST00000545678	CD40	P25942	277 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	AOAH	P28039	575 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	GSTT1	P30711	240 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	MTNR1A	P48039	350 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	RNF4	P78317	190 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	PPA1	Q15181	289 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	SLC35C1	Q96A29	364 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	R3HDM4	Q96D70	268 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	ADGRG7	Q96K78	797 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	CSF3R	Q99062	836 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	CHST10	O43529	356 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	B3GALT4	O96024	378 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	HMGCL	P35914	325 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	SLC6A8	P48029	635 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	RFX3	P48380	749 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	VEGFC	P49767	419 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	CDH6	P55285	790 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	BECN1	Q14457	450 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	PTPRCAP	Q14761	206 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	BRD3	Q15059	726 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	ANKRD1	Q15327	319 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	FAR2	Q96K12	515 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	TCF12	Q99081	682 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	XPR1	Q9UBH6	696 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	CCDC151	A5D8V7	595 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	TXNDC9	O14530	226 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	HAT1	O14929	419 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	GPR137B	O60478	399 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	HLA-DQB2	P05538	268 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	CYP11B1	P15538	503 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	JAK1	P23458	1154 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	NOMO3	P69849	1222 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	IFT88	Q13099	833 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	ITGA9	Q13797	1035 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	NOMO1	Q15155	1222 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	PON3	Q15166	354 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	MPEG1	Q2M385	716 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	VRK3	Q8IV63	474 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	ZNF398	Q8TD17	642 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	C18orf15	Q96N68	181 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	PINK1	Q9BXM7	581 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	WWOX	Q9NZC7	414 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	BMP15	O95972	392 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	IFNW1	P05000	195 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	CHRM2	P08172	466 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	CHAT	P28329	748 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	FMO5	P49326	533 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	IL1RL1	Q01638	556 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	MLC1	Q15049	377 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	STK11	Q15831	433 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM7-208	ENST00000545678	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		7.49	□□□□□ -1.21

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