RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1W2PR48 441 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 A1L4Q6 167 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC14BA6NHZ5 514 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 GLOD5A6NK44 160 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 E9PLN8 166 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 CCL21O00585 134 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TM9SF1O15321 606 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TMPRSS11DO60235 418 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 HS6ST1O60243 411 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 NPHS1O60500 1241 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 HCN1O60741 890 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 SEC22BO75396 215 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 NEURL1O76050 574 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 HSPA4LO95757 839 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 PROCP04070 461 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 IGKV3-11P04433 115 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXO45P0C2W1 286 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 GABRA1P14867 456 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 DDCP20711 480 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 GRK2P25098 689 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 COL8A1P27658 744 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 IL12BP29460 328 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 PTGS2P35354 604 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 SOX3P41225 446 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 CA7P43166 264 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 UQCRFS1P47985 274 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 HK2P52789 917 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC37A1P57057 533 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ERVK-8P63133 956 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ID2Q02363 134 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC18A2Q05940 514 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 FUT7Q11130 342 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 MAP4K2Q12851 820 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ART3Q13508 389 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 EFR3AQ14156 821 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 RPS6KA2Q15349 733 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT71Q3SY84 523 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 UNC50Q53HI1 259 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 C18orf63Q68DL7 685 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 GALNT18Q6P9A2 607 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 BHLHB9Q6PI77 547 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF165Q6ZSG1 346 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ACAD11Q709F0 780 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM46Q7Z4K8 759 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 FJX1Q86VR8 437 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 SULF2Q8IWU5 870 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM42Q8IWZ5 723 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 OR4N5Q8IXE1 308 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 PM20D2Q8IYS1 436 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 CLYBLQ8N0X4 340 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXW8Q8N3Y1 598 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 KIF2BQ8N4N8 673 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 MREGQ8N565 214 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 CEP70Q8NHQ1 597 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF721Q8TF20 911 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 CHTF18Q8WVB6 975 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ASB5Q8WWX0 329 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF597Q96LX8 424 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP3R2Q96LZ3 170 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 FRMD6Q96NE9 622 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ZIM3Q96PE6 472 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM237Q96Q45 408 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 VKORC1Q9BQB6 163 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 DOHHQ9BU89 302 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM109Q9BVC6 243 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 WWTR1Q9GZV5 400 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 AICDAQ9GZX7 198 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 CENPHQ9H3R5 247 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 METTL7AQ9H8H3 244 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB26Q9HCK0 441 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ZFP64Q9NPA5 681 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 SDHAF3Q9NRP4 125 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 C1orf109Q9NX04 203 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 SIRT5Q9NXA8 310 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 BCAP29Q9UHQ4 241 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 LGALS13Q9UHV8 139 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ACAD8Q9UKU7 415 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ERVK-19Q9WJR5 959 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 PLLPQ9Y342 182 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 OR10H1Q9Y4A9 318 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 CSAG2Q9Y5P2 127 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ACTL7BQ9Y614 415 aa5.19□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ZGRF1Q86YA3 2104 aa5.18□□□□□ -1.58
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