RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 POFUT2Q9Y2G5 429 aa19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM221BA6H8Z2 402 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 H3BMQ9 156 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 GADD45GO95257 159 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 OR12D1P0DN82 309 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 CD247P20963 164 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 BNC1Q01954 994 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 PIGFQ07326 219 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 PROX2Q3B8N5 592 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC48A1Q6P1K1 146 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 VN1R4Q7Z5H5 301 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 ASPGQ86U10 573 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 SFXN5Q8TD22 340 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 GAL3ST3Q96A11 431 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 COG8Q96MW5 612 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC90BQ9GZT6 254 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 LHPPQ9H008 270 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 OR51I1Q9H343 314 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 SERHL2Q9H4I8 314 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF556Q9HAH1 456 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 GIMAP4Q9NUV9 329 aa19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3-211ENST00000539589 LMO7DNF2Z398 122 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 PROM1O43490 865 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 LAMTOR5O43504 91 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 CTSVO60911 334 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 SERPINB7O75635 380 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 PIAS2O75928 621 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 PVRP15151 417 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 TYRP1P17643 537 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 MATN1P21941 496 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 LIMS1P48059 325 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 TMBIM6P55061 237 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 C21orf59P57076 290 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 BTN3A2P78410 334 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 MAPK11Q15759 364 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 PMS2CLQ68D20 193 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 XAGE5Q8WWM1 108 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 MOAP1Q96BY2 351 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 TRPC4Q9UBN4 977 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 CES1P1Q9UKY3 287 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 DOLKQ9UPQ8 538 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 RECKO95980 971 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 ITIH1P19827 911 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP2R1BP30154 601 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 FASLGP48023 281 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 KHKP50053 298 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 C18orf63Q68DL7 685 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 FIGLAQ6QHK4 219 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 NT5CQ8TCD5 201 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 PSD2Q9BQI7 771 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 DUSP21Q9H596 190 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 RLIMQ9NVW2 624 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 ASXL3Q9C0F0 2248 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 OR5K3A6NET4 321 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 C2orf74A8MZ97 194 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 CCNB2O95067 398 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC35G6P0C7Q6 338 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 NR2F1P10589 423 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 MPIP34949 423 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 BNIP3Q12983 259 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 GANABQ14697 944 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 LYSMD4Q5XG99 296 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT73Q86Y46 540 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 C1orf210Q8IVY1 113 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC116Q8IYX3 515 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM105Q8N8V8 129 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 KCT2Q8NC54 265 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 SUN3Q8TAQ9 357 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 MUL1Q969V5 352 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 AASSQ9UDR5 926 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 SEC14L3Q9UDX4 400 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 PSME2Q9UL46 239 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 ARRDC5A6NEK1 342 aa19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDH17O14917 1159 aa19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 CTSKP43235 329 aa19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNJ5P48544 419 aa19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKAG1P54619 331 aa19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 CSNK2BP67870 215 aa19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC35A2P78381 396 aa19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 GNA13Q14344 377 aa19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3-211ENST00000539589 OGFOD3Q6PK18 319 aa19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms