RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	TAF13	Q15543	124 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CAMK4	Q16566	473 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TATDN3	Q17R31	274 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	FGD3	Q5JSP0	725 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	DCAF10	Q5QP82	559 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CENPU	Q71F23	418 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	KMT5C	Q86Y97	462 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ELMOD1	Q8N336	334 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PARP8	Q8N3A8	854 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR148	Q8TDV2	347 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	NR4A3	Q92570	626 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC35C1	Q96A29	364 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	RASD2	Q96D21	266 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	IGSF21	Q96ID5	467 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF479	Q96JC4	524 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	C4orf45	Q96LM5	186 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	VSTM2L	Q96N03	204 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	USP28	Q96RU2	1077 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	NLN	Q9BYT8	704 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	LAT2	Q9GZY6	243 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	APMAP	Q9HDC9	416 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	BARHL2	Q9NY43	387 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PSME2	Q9UL46	239 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	RIPK3	Q9Y572	518 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	LAMC1	P11047	1609 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	MADD	Q8WXG6	1647 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ZMYM6	O95789	1325 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ASB14	A6NK59	587 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	MEI4	A8MW99	385 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ACOT8	O14734	319 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	JAK2	O60674	1132 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SDC3	O75056	442 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ECI2	O75521	394 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	NEBL	O76041	1014 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TXNDC12	O95881	172 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GLUD1	P00367	558 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	VTN	P04004	478 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	LYN	P07948	512 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GSTT2	P0CG29	244 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GSTT2B	P0CG30	244 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PNMT	P11086	282 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC130	P13994	396 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GP9	P14770	177 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF44	P15621	663 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF12	P17014	697 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GPX3	P22352	226 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GLUD2	P49448	558 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PCYT1A	P49585	367 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PRMT2	P55345	433 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TGM3	Q08188	693 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	NFATC4	Q14934	902 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	HLF	Q16534	295 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GPBP1	Q86WP2	473 aa		3.56	□□□□□ -1.84

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