RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC14	Q49A88	953 aa		3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	KRT39	Q6A163	491 aa		3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	RAPH1	Q70E73	1250 aa		3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	TMUB2	Q71RG4	321 aa		3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	P2RX5	Q93086	422 aa		3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	SERAC1	Q96JX3	654 aa		3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC42	Q96M95	316 aa		3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	IL12RB2	Q99665	862 aa		3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	HYPK	Q9NX55	129 aa		3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	POLL	Q9UGP5	575 aa		3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	NCAPD2	Q15021	1401 aa		3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	ABCC4	O15439	1325 aa		3.16	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		3.15	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		3.15	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	ITGB4	P16144	1822 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1B0GVG6	124 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057		E9PAM4	449 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	AP3B1	O00203	1094 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	SIGLEC5	O15389	551 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	LCA5L	O95447	670 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ANP32D	O95626	131 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	APOE	P02649	317 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	LDHC	P07864	332 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	GHR	P10912	638 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF19	P17023	458 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	GIF	P27352	417 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	EPS15	P42566	896 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	MTCP1	P56278	107 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	MAP3K7CL	P57077	242 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CTAG1A	P78358	180 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CCZ1B	P86790	482 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	RIPK1	Q13546	671 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	KCTD2	Q14681	263 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	PSMD6	Q15008	389 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	UTF1	Q5T230	341 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	TTC27	Q6P3X3	843 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	BRINP3	Q76B58	766 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	PCGF5	Q86SE9	256 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	VPS36	Q86VN1	386 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ERICH1	Q86X53	443 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	SNX32	Q86XE0	403 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	PARP8	Q8N3A8	854 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC63	Q8NA47	563 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	SPERT	Q8NA61	448 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CDKL2	Q92772	493 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ERP27	Q96DN0	273 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	OLFM3	Q96PB7	478 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ZIM3	Q96PE6	472 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CENPK	Q9BS16	269 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	NUP58	Q9BVL2	599 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	FZD8	Q9H461	694 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	IL20	Q9NYY1	176 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ASB3	Q9Y575	518 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		3.15	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		3.15	□□□□□ -1.91

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