RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 OR1N1Q8NGS0 311 aa12.47□□□□□ -0.41
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PGGT1B-204ENST00000503638 ABHD17AQ96GS6 310 aa12.47□□□□□ -0.41
PGGT1B-204ENST00000503638 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
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PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa12.47□□□□□ -0.41
PGGT1B-204ENST00000503638 EPS8L2Q9H6S3 715 aa12.47□□□□□ -0.41
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PGGT1B-204ENST00000503638 ABI3Q9P2A4 366 aa12.47□□□□□ -0.41
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PGGT1B-204ENST00000503638 SLC22A3O75751 556 aa12.46□□□□□ -0.41
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PGGT1B-204ENST00000503638 LAMP1P11279 417 aa12.46□□□□□ -0.41
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PGGT1B-204ENST00000503638 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 ACER2Q5QJU3 275 aa12.45□□□□□ -0.42
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PGGT1B-204ENST00000503638 OR5L2Q8NGL0 311 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 ELP5Q8TE02 316 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF721Q8TF20 911 aa12.45□□□□□ -0.42
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PGGT1B-204ENST00000503638 GLIPR2Q9H4G4 154 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 CDCP1Q9H5V8 836 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
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PGGT1B-204ENST00000503638 MAT2BQ9NZL9 334 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 PCDHGB4Q9UN71 923 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 GPR45Q9Y5Y3 372 aa12.45□□□□□ -0.42
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PGGT1B-204ENST00000503638 DGKQP52824 942 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 PRKAG1P54619 331 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 RNF4P78317 190 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 MAP4K2Q12851 820 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 NNATQ16517 81 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 MEP1AQ16819 746 aa12.44□□□□□ -0.42
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