RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	FRG2B	Q96QU4	278 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	OR2A14	Q96R47	310 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	HAUS8	Q9BT25	410 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	BRF2	Q9HAW0	419 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	AIG1	Q9NVV5	245 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	SPAST	Q9UBP0	616 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	HEY2	Q9UBP5	337 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	KLK13	Q9UKR3	277 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	DAPP1	Q9UN19	280 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	USP22	Q9UPT9	525 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	TIMM22	Q9Y584	194 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DCTN1-222	ENST00000492717	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		5.4	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A087X0M5	115 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A1B0GX30	115 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	OR5K3	A6NET4	321 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717		H3BMH7	237 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	SCEL	O95171	688 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	PDYN	P01213	254 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	C9	P02748	559 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	INHBB	P09529	407 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ALPPL2	P10696	532 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	CDH1	P12830	882 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	GPX3	P22352	226 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	GSTM2	P28161	218 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	PRDX6	P30041	224 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	CPOX	P36551	454 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	CAPZB	P47756	277 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	GABRA4	P48169	554 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ACADVL	P49748	655 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ARFIP1	P53367	373 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	NR1H2	P55055	460 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	CASP6	P55212	293 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ERVK-8	P63133	956 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ABAT	P80404	500 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	CFHR1	Q03591	330 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	EMX2	Q04743	252 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	C1orf61	Q13536	156 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	CCNI	Q14094	377 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	RCAN2	Q14206	197 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	GRM7	Q14831	915 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	KIR2DS3	Q14952	304 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	NAA25	Q14CX7	972 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ZIC1	Q15915	447 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	RBBP7	Q16576	425 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM198	Q66K66	360 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	GKN2	Q86XP6	184 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	GPR135	Q8IZ08	494 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ARL14	Q8N4G2	192 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	EID2	Q8N6I1	236 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	POC1B	Q8TC44	478 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	METTL6	Q8TCB7	284 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	AGR3	Q8TD06	166 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		5.39	□□□□□ -1.55

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