RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TUBA1CQ9BQE3 449 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DPAGT1Q9H3H5 408 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF69Q9UC07 566 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPIPA1Q9UND3 350 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFT52Q9Y366 437 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PENKP01210 267 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HTR1AP08908 422 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GADD45AP24522 165 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAN2A2P49641 1150 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAS2R38P59533 333 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SHC2P98077 582 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRHL2Q6ISB3 625 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXO42Q6P3S6 717 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FXYD6Q9H0Q3 95 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACTL8Q9H568 366 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UPB1Q9UBR1 384 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SERTAD3Q9UJW9 196 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBP2O00757 339 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CEACAM19Q7Z692 300 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GALNT7Q86SF2 657 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC15A4Q8N697 577 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRPEL2Q8TAA5 225 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBXN10Q96LJ8 280 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MNTQ99583 582 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPSD1Q9BZJ3 242 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 METTL7AQ9H8H3 244 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF13O43567 381 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 YES1P07947 543 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UGT3A2Q3SY77 523 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NIPAL1Q6NVV3 410 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF367Q7RTV3 350 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MSLNLQ96KJ4 702 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAGIXQ9H6Y5 334 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKMY1Q9P2S6 941 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RETP07949 1114 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AK4P27144 223 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADRA1AP35348 466 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GDI2P50395 445 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDK5R2Q13319 367 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NRMQ8IXM6 262 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR5D16Q8NGK9 328 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MVB12BQ9H7P6 319 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SFXN1Q9H9B4 322 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JUNDP17535 347 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITIH1P19827 911 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CPOXP36551 454 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SELPLGQ14242 412 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CTSL3PQ5NE16 218 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LIPIQ6XZB0 460 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TFAP2CQ92754 450 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DLEC1Q9Y238 1755 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9J4A7 227 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GSTM2P28161 218 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NTSR1P30989 418 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADH7P40394 386 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HOXC5Q00444 222 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNIH4Q9P003 139 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RIMS3Q9UJD0 308 aa15.78■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLOD2O00469 737 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPARCP09486 303 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF45Q02386 682 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP4K2Q12851 820 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAPK14Q16539 360 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAVSQ7Z434 540 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACBD7Q8N6N7 88 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABHD11Q8NFV4 315 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FNDC8Q8TC99 324 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF639Q9UID6 485 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDH10Q9Y6N8 788 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HMX2A2RU54 273 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GABRR3A8MPY1 467 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KDM4BO94953 1096 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBRG1Q3YBR2 411 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MANEALQ5VSG8 457 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PAQR7Q86WK9 346 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC44A3Q8N4M1 653 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF615Q8N8J6 731 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYB561A3Q8NBI2 242 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PEX11GQ96HA9 241 aa15.77■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms