RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481477.5

SETD4-215, Transcript of SET domain containing 4, human

TSL 1 (best)

Gene SETD4, Length 2,761 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SETD4-215	ENST00000481477	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	PLXNA2	O75051	1894 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	TSPAN11	A1L157	253 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	PCDH7	O60245	1069 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	NPPB	P16860	134 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	MAPK1	P28482	360 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	PTGER1	P34995	402 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	STK11	Q15831	433 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	ZNF385B	Q569K4	471 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	PYDC2	Q56P42	97 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	GANC	Q8TET4	914 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	HERVK_113	Q902F9	699 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	OPALIN	Q96PE5	141 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	DUSP26	Q9BV47	211 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	HHATL	Q9HCP6	504 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	FEZF1	A0PJY2	475 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	FABP12	A6NFH5	140 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	SLC16A5	O15375	505 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	NFATC1	O95644	943 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	SERPIND1	P05546	499 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	KLK1	P06870	262 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	GABRB1	P18505	474 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	ITGB7	P26010	798 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	ITGA1	P56199	1179 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	PER3	P56645	1201 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	ABHD18	Q0P651	414 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	POU4F3	Q15319	338 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	CPTP	Q5TA50	214 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	LIPJ	Q5W064	366 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	PBX4	Q9BYU1	374 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	FZD3	Q9NPG1	666 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	NIN	Q8N4C6	2090 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	EPOP	A6NHQ4	379 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	LILRB5	O75023	590 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	PRPS1L1	P21108	318 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	RGS1	Q08116	209 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	COX20	Q5RI15	118 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	VIT	Q6UXI7	678 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	FEV	Q99581	238 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	XKR8	Q9H6D3	395 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	RLIM	Q9NVW2	624 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477		A0A1W2PP55	124 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	WWP2	O00308	870 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	MYL12B	O14950	172 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	BET1	O15155	118 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	PDE9A	O76083	593 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	TSPAN19	P0C672	248 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	MYL12A	P19105	171 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	CRAT	P43155	626 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	MAP2K3	P46734	347 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	TAP2	Q03519	686 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	RUNX1T1	Q06455	604 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	MAB21L1	Q13394	359 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	C2orf27A	Q580R0	203 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	MED27	Q6P2C8	311 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	FAM124A	Q86V42	546 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	COMMD7	Q86VX2	200 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	TIGD4	Q8IY51	512 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	OR56A3	Q8NH54	315 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	ASIC5	Q9NY37	505 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	TAC3	Q9UHF0	121 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	FZD4	Q9ULV1	537 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SETD4-215	ENST00000481477	SCML1	Q9UN30	329 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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