RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 LTB4RQ15722 352 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 XKR7Q5GH72 579 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 OPN5Q6U736 354 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 TICAM1Q8IUC6 712 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 SULF2Q8IWU5 870 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 DDIASQ8IXT1 998 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 VWA5B2Q8N398 1253 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 SIMC1Q8NDZ2 872 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 CDC26Q8NHZ8 85 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 TLCD1Q96CP7 247 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 EGLN2Q96KS0 407 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 GAL3ST4Q96RP7 486 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 PFDN4Q9NQP4 134 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa19.36■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 TMEM114B3SHH9 223 aa19.36■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 PEX1O43933 1283 aa19.36■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
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ACTB-211ENST00000480301 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 ZNF628Q5EBL2 1059 aa19.36■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 C6orf163Q5TEZ5 329 aa19.36■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 IKBIPQ70UQ0 350 aa19.36■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 SLC15A4Q8N697 577 aa19.36■□□□□ 0.69
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ACTB-211ENST00000480301 PSD4Q8NDX1 1056 aa19.36■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 PRR7Q8TB68 274 aa19.36■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A8Q8TCC7 542 aa19.36■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 ZNF675Q8TD23 568 aa19.36■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 ADIPOR1Q96A54 375 aa19.36■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 C20orf27Q9GZN8 174 aa19.36■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R7Q9NYW3 318 aa19.36■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 DTX4Q9Y2E6 619 aa19.36■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 TMEM120BA0PK00 339 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 MYO1GB0I1T2 1018 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 HSPA4LO95757 839 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 CBX7O95931 251 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 PCSK2P16519 638 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 BGNP21810 368 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 MEOX1P50221 254 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 WDR4P57081 412 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 RPL38P63173 70 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
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ACTB-211ENST00000480301 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 GALNTL6Q49A17 601 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 RNFT1Q5M7Z0 435 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 RTL4Q6ZR62 310 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD42Q8N9B4 389 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 OR9A2Q8NGT5 310 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 C16orf52Q8NHV5 167 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 TP53INP1Q96A56 240 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 SGCZQ96LD1 299 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 C3orf30Q96M34 536 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 CCT7Q99832 543 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 DEPPQ9NTK1 212 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 GIMAP4Q9NUV9 329 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 GIMAP2Q9UG22 337 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 ENTPD4Q9Y227 616 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 TMED5Q9Y3A6 229 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 SDC1P18827 310 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 GPX3P22352 226 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 GRK2P25098 689 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 SLC18A1P54219 525 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 GPR85P60893 370 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 FHL5Q5TD97 284 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 HHATQ5VTY9 493 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 SIAH3Q8IW03 269 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 FAM26EQ8N5C1 309 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 ZNF781Q8N8C0 355 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 GOLM1Q8NBJ4 401 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 SORT1Q99523 831 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 SH2D2AQ9NP31 389 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 MIEF1Q9NQG6 463 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 CROCCQ5TZA2 2017 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTB-211ENST00000480301 PEX11AO75192 247 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 SEMA7AO75326 666 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 FBXO45P0C2W1 286 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 MPIP34949 423 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 SLC1A6P48664 564 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 TAGAPQ8N103 731 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 POGLUT1Q8NBL1 392 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 OR52R1Q8NGF1 315 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 KAT2AQ92830 837 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
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