RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477447.6

TARDBP-208, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-208	ENST00000477447	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	APOOL	Q6UXV4	268 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447		Q6ZR54	194 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	MOB2	Q70IA6	237 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	BNIPL	Q7Z465	357 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	GPR142	Q7Z601	462 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	LUZP1	Q86V48	1076 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	ARL14	Q8N4G2	192 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	NTNG2	Q96CW9	530 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	CAPNS2	Q96L46	248 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	ZBP1	Q9H171	429 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	DCTPP1	Q9H773	170 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	AMBN	Q9NP70	447 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	RNF24	Q9Y225	148 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447		A0A1B0GVY2	172 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	SYCE3	A1L190	88 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	TRIM64B	A6NI03	449 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	PHOX2A	O14813	284 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	CFLAR	O15519	480 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	LRP3	O75074	770 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	RHBDL1	O75783	438 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	PIGR	P01833	764 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	HLA-DPA1	P20036	260 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	CCL11	P51671	97 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF131	P52739	623 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	HMGCS2	P54868	508 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	CBX3	Q13185	183 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	ADCK1	Q86TW2	530 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	NAXD	Q8IW45	347 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	GPD1L	Q8N335	351 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	CD177	Q8N6Q3	437 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	MGARP	Q8TDB4	240 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	TBCK	Q8TEA7	893 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	ATP6V0B	Q99437	205 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	NRN1	Q9NPD7	142 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	MLX	Q9UH92	298 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	APPL1	Q9UKG1	709 aa		2.55	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447		A0A0A6YYD4	124 aa		2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	E2F3	O00716	465 aa		2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	CYB561D2	O14569	222 aa		2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	NUDT14	O95848	222 aa		2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	THY1	P04216	161 aa		2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	NPY2R	P49146	381 aa		2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	ARHGDIA	P52565	204 aa		2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	NAAA	Q02083	359 aa		2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	SLC10A1	Q14973	349 aa		2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	CARTPT	Q16568	116 aa		2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447		Q1RN00	199 aa		2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	VIT	Q6UXI7	678 aa		2.54	□□□□□ -2
TARDBP-208	ENST00000477447	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		2.54	□□□□□ -2

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