RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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SHQ1-207ENST00000475558 LRFN5Q96NI6 719 aa6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 NRTNQ99748 197 aa6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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SHQ1-207ENST00000475558 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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SHQ1-207ENST00000475558 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 A0A1B0GX78 115 aa6.59□□□□□ -1.35
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SHQ1-207ENST00000475558 ZNF749O43361 778 aa6.59□□□□□ -1.35
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SHQ1-207ENST00000475558 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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SHQ1-207ENST00000475558 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 SEPHS1P49903 392 aa6.59□□□□□ -1.35
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SHQ1-207ENST00000475558 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.59□□□□□ -1.35
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SHQ1-207ENST00000475558 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ART5Q96L15 291 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 PPM1MQ96MI6 270 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 RNF145Q96MT1 663 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.59□□□□□ -1.35
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