RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	DLX3	O60479	287 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	WDR1	O75083	606 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	CDH16	O75309	829 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	TOX	O94900	526 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	PDYN	P01213	254 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	GBA	P04062	536 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	TAC1	P20366	129 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	ACVR2A	P27037	513 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	GSTM5	P46439	218 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	MAPK12	P53778	367 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	PRKAA2	P54646	552 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	PKNOX1	P55347	436 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	PLGLB1	Q02325	96 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	RPS6KA2	Q15349	733 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	RTL6	Q6ICC9	239 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF675	Q8TD23	568 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	RND1	Q92730	232 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	SARAF	Q96BY9	339 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	OR10A5	Q9H207	317 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	MCM8	Q9UJA3	840 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	RNF6	Q9Y252	685 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	CFL2	Q9Y281	166 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	F8	P00451	2351 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM166B	A8MTA8	275 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307		H3BQF6	201 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	MANBA	O00462	879 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	TP53I11	O14683	189 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	T	O15178	435 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	ACOX3	O15254	700 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	SNX4	O95219	450 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	KRT6A	P02538	564 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	KRT6B	P04259	564 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	CAPN3	P20807	821 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	GPX3	P22352	226 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	MSX1	P28360	303 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	SSTR4	P31391	388 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	PIGA	P37287	484 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	KRT6C	P48668	564 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	CDH13	P55290	713 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	PSPH	P78330	225 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	LCP2	Q13094	533 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	TDRP	Q86YL5	185 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	RNF138	Q8WVD3	245 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF592	Q92610	1267 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	LURAP1	Q96LR2	239 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM237	Q96Q45	408 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	PPCS	Q9HAB8	311 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	PSME2	Q9UL46	239 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	NIN	Q8N4C6	2090 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PGAP2-215	ENST00000469307	HCFC1	P51610	2035 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307		G3V3Y1	287 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	PDE9A	O76083	593 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	OR4F21	O95013	312 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	ESRRB	O95718	433 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	HPN	P05981	417 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	CELA3A	P09093	270 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM153B	P0C7A2	387 aa		11.33	□□□□□ -0.6

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