RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PARVG	Q9HBI0	331 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SGK2	Q9HBY8	427 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	RNF103	O00237	685 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	T	O15178	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SLC7A4	O43246	635 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	BAG2	O95816	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ERVK-10	P10266	1014 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ADORA2B	P29275	332 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	EPHA2	P29317	976 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	DRD3	P35462	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ETV5	P41161	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	RAB28	P51157	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	MYL6	P60660	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PLA2G7	Q13093	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TRIM29	Q14134	588 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	MELK	Q14680	651 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CST6	Q15828	149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CDKN3	Q16667	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	C12orf29	Q8N999	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	HDAC11	Q96DB2	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	HHATL	Q9HCP6	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080		H0YCG3	227 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC188	H7C350	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080		K7EM74	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	YKT6	O15498	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	LAT	O43561	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TGDS	O95455	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ACP2	P11117	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ERCC2	P18074	760 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ITIH1	P19827	911 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PTMS	P20962	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	GJB2	P29033	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ATP12A	P54707	1039 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SIRPA	P78324	504 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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