RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 ACSL5Q9ULC5 683 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 KLHL20Q9Y2M5 609 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 MYO10Q9HD67 2058 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 CHD9Q3L8U1 2897 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 PGRMC2O15173 223 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 ERI3O43414 337 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 CLEC3AO75596 197 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 DRD2P14416 443 aa15.99■□□□□ 0.15
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ACTB-207ENST00000462494 RPS19P39019 145 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
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ACTB-207ENST00000462494 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
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ACTB-207ENST00000462494 GPAT3Q53EU6 434 aa15.99■□□□□ 0.15
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ACTB-207ENST00000462494 OR2A1Q8NGT9 310 aa15.99■□□□□ 0.15
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ACTB-207ENST00000462494 MKLN1Q9UL63 735 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 OR52A4PA6NMU1 304 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 MYL12BO14950 172 aa15.98■□□□□ 0.15
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ACTB-207ENST00000462494 TP53P04637 393 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 CHRM4P08173 479 aa15.98■□□□□ 0.15
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ACTB-207ENST00000462494 TMEM240Q5SV17 173 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 AGBL4Q5VU57 503 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
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ACTB-207ENST00000462494 COL4A3Q01955 1670 aa15.98■□□□□ 0.15
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ACTB-207ENST00000462494 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa15.98■□□□□ 0.15
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ACTB-207ENST00000462494 HDDC3Q8N4P3 179 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 GPA33Q99795 319 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 SLC30A2Q9BRI3 323 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
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ACTB-207ENST00000462494 TEX101Q9BY14 249 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 TPK1Q9H3S4 243 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 RERGLQ9H628 205 aa15.98■□□□□ 0.15
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ACTB-207ENST00000462494 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 KLHL3Q9UH77 587 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 ATG4BQ9Y4P1 393 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 A0A1W2PP55 124 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 CYP7B1O75881 506 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 EPPINO95925 133 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 PCYT1AP49585 367 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 DEFA1P59665 94 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 DEFA3P59666 94 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 C1DQ13901 141 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 ACSM5Q6NUN0 579 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 TMEM107Q6UX40 140 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 OR8H2Q8N162 312 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 NANOGP1Q8N7R0 232 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 C16orf58Q96GQ5 468 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 ABHD8Q96I13 439 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 LRR1Q96L50 414 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa15.97■□□□□ 0.15
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