RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 LANCL3Q6ZV70 420 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKRD46Q86W74 232 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 OR7G2Q8NG99 324 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 OR14A16Q8NHC5 309 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 ZFP28Q8NHY6 868 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 FBXO27Q8NI29 283 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 SFXN5Q8TD22 340 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 ROPN1LQ96C74 230 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 RCN3Q96D15 328 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 ELP4Q96EB1 424 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 GIMAP5Q96F15 307 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 FBXL20Q96IG2 436 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 ITCHQ96J02 903 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 SEMA4CQ9C0C4 833 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 RMND5AQ9H871 391 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 SLAMF8Q9P0V8 285 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 IL17BQ9UHF5 180 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 LOC100653049A0A140TA62 436 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 SAGE2PA6NJ88 616 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 UPK1AO00322 258 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 MRASO14807 208 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 KRT34O76011 436 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 UNC5CO95185 931 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 COX6A1P12074 109 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 BMP2P12643 396 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 ITPKBP27987 946 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 MC3RP41968 323 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 MAGEA8P43361 318 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 AP2B1P63010 937 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 GTDC1Q4AE62 458 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 SAXO2Q658L1 398 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 KIRREL2Q6UWL6 708 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 MRGPREQ86SM8 312 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 DHDDSQ86SQ9 333 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF615Q8N8J6 731 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 APCDD1LQ8NCL9 501 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 VPS37AQ8NEZ2 397 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 OR11G2Q8NGC1 345 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 MIPOL1Q8TD10 442 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 ZFP90Q8TF47 636 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 NEURL3Q96EH8 262 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 NSL1Q96IY1 281 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 IMMP1LQ96LU5 166 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 DGAT2Q96PD7 388 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 BBS4Q96RK4 519 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 NPAS2Q99743 824 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF700Q9H0M5 742 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 C1orf21Q9H246 121 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 CPNE5Q9HCH3 593 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 VAPAQ9P0L0 249 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 PTGFRNQ9P2B2 879 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 ABCD2Q9UBJ2 740 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 LAMA5O15230 3695 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 CACNA1GO43497 2377 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 CROCCQ5TZA2 2017 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC88CQ9P219 2028 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 HRKO00198 91 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 EBAG9O00559 213 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 RFXANKO14593 260 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 DYRK3O43781 588 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 C1QCP02747 245 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 UQCRC2P22695 453 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC6A2P23975 617 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 PTGER1P34995 402 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 MAN2A2P49641 1150 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 MNAT1P51948 309 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 MANFP55145 182 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 HSPB3Q12988 150 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 FXNQ16595 210 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 SFT2D3Q587I9 215 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 C6orf163Q5TEZ5 329 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 FAAH2Q6GMR7 532 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM111BQ6SJ93 734 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM107Q6UX40 140 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-207ENST00000454947 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.6 ms