RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 RPS13P62277 151 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CDKL4Q5MAI5 379 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 DEPDC1Q5TB30 811 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SHEQ5VZ18 495 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 VASNQ6EMK4 673 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 GRHL2Q6ISB3 625 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PLXDC2Q6UX71 529 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 LAS2Q8IYD9 372 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 GCNT2Q8N0V5 402 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 OR1J4Q8NGS1 313 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 RDH11Q8TC12 318 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 WDYHV1Q96HA8 205 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SMYD2Q9NRG4 433 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 MOCS1Q9NZB8 636 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 KLRF1Q9NZS2 232 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SNX12Q9UMY4 172 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 MAPRE3Q9UPY8 281 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 HIVEP2P31629 2446 aa9.41□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 FBN3Q75N90 2809 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 WASHC1A8K0Z3 465 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 H7C1Q1 480 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 K7EPI3 171 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 LY6G6DO95868 133 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 IL18BPO95998 194 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 GBAP04062 536 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CLPSP04118 112 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 NT5EP21589 574 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PIK3R1P27986 724 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CASP3P42574 277 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 RAB10P61026 200 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PCDH1Q08174 1060 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 FOXF2Q12947 444 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 OR52E8Q6IFG1 317 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 NUDT13Q86X67 352 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CTAGE3PQ8IX95 158 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TEX9Q8N6V9 391 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF441Q8N8Z8 693 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 OR14L1PQ8NHC6 308 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF592Q92610 1267 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM41AQ96HV5 264 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 Q96MF0 132 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 DACH2Q96NX9 599 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 RBBP8Q99708 897 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CCL19Q99731 98 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CPNE1Q99829 537 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TUBA1CQ9BQE3 449 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SFXN3Q9BWM7 321 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 OSBPL11Q9BXB4 747 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ANGPTL4Q9BY76 406 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 UBQLN3Q9H347 655 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ACTR8Q9H981 624 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CALHM2Q9HA72 323 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 UBTD1Q9HAC8 227 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 A0A0A6YYD5 115 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PPR1 153 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PR48 441 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PS29 197 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 C2orf72A6NCS6 295 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 EFCAB8A8MWE9 144 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 TMPRSS11DO60235 418 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 CT62P0C5K7 136 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 FAM58BPP0C7Q3 252 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 SLC35E2BP0CK96 405 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 SLC35E2P0CK97 266 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 CNTFP26441 200 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 PTPN6P29350 595 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 GP5P40197 560 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 SLCO1A2P46721 670 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 NAGLUP54802 743 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 DIO3P55073 304 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 PPP2R2BQ00005 443 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 PLCXD2Q0VAA5 305 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 NHSL2Q5HYW2 709 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 FNDC7Q5VTL7 733 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 P4HA3Q7Z4N8 544 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 CMC1Q7Z7K0 106 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 STAG3L4Q8TBR4 150 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 PYROXD1Q8WU10 500 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-211ENST00000449757 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms