RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	LHPP	Q9H008	270 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR10A5	Q9H207	317 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	MMP25	Q9NPA2	562 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	SAR1A	Q9NR31	198 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACACB	O00763	2458 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPR143	P51810	404 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	WNT3	P56703	355 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	MGAT2	Q10469	447 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	GK5	Q6ZS86	529 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR7G2	Q8NG99	324 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF675	Q8TD23	568 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ELP5	Q8TE02	316 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ELP4	Q96EB1	424 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRORY	Q9H606	182 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	MRGBP	Q9NV56	204 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPR83	Q9NYM4	423 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARMCX1	Q9P291	453 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	FCHO1	O14526	889 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	NDUFAB1	O14561	156 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZFAND5	O76080	213 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGKV3-11	P04433	115 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	CD1E	P15812	388 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	S1PR1	P21453	382 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	SOAT1	P35610	550 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC37A1	P57057	533 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	HBA1	P69905	142 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF4	P78317	190 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	FUT7	Q11130	342 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	MLC1	Q15049	377 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPDL1	Q96EA4	605 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	PANX1	Q96RD7	426 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	RMND5A	Q9H871	391 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZZEF1	O43149	2961 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	UPK1A	O00322	258 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLOD2	O00469	737 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLOD3	O60568	738 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRAMEF2	O60811	474 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLITRK5	O94991	958 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANP32D	O95626	131 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	CBX7	O95931	251 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ITGB2	P05107	769 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	SOX18	P35713	384 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	KLF10	Q13118	480 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	RCAN2	Q14206	197 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC5A8	Q8N695	610 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	AGAP4	Q96P64	663 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		12.72	□□□□□ -0.37

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