RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441439.6

LMO3-208, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,515 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-208ENST00000441439 MXD1Q05195 221 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 GPR162Q16538 588 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 VASNQ6EMK4 673 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 GRHL2Q6ISB3 625 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 TRIM40Q6P9F5 258 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 SERPINA9Q86WD7 417 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 MIB1Q86YT6 1006 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 THEM5Q8N1Q8 247 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 PLEKHA1Q9HB21 404 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 ENTPD4Q9Y227 616 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 ANKDD1BA6NHY2 528 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 TBX19O60806 448 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 GUCA1CO95843 209 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 CFDP00746 253 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 LIMS3P0CW19 117 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 LIMS4P0CW20 117 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 ELK1P19419 428 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 TACR2P21452 398 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 DNASE1P24855 282 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 NNMTP40261 264 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 DGKGP49619 791 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 ZP1P60852 638 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 CDK6Q00534 326 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 FGFBP1Q14512 234 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 EOGTQ5NDL2 527 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 RAET1GQ6H3X3 334 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 PAQR6Q6TCH4 344 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 WASH2PQ6VEQ5 465 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 TPRA1Q86W33 373 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 TEX19Q8NA77 164 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 BVESQ8NE79 360 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 OR56B4Q8NH76 319 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 ASB13Q8WXK3 278 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 OTULINQ96BN8 352 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 EID2BQ96D98 161 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 ZFP42Q96MM3 310 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 TCF25Q9BQ70 676 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 CWH43Q9H720 699 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 NANSQ9NR45 359 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 GULP1Q9UBP9 304 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 EPHA6Q9UF33 1036 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 A0A1W2PRQ8 180 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 J3KTA2 159 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 J3QRE1 110 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 M0R233 179 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 SOX30O94993 753 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 PITPNBP48739 271 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 INPP1P49441 399 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 LIM2P55344 173 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 CDH18Q13634 790 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 TRAM1Q15629 374 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 ZNF284Q2VY69 593 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 SGO1Q5FBB7 561 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 ELFN2Q5R3F8 820 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 SLC36A4Q6YBV0 504 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 FAM217AQ8IXS0 508 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 DBF4BQ8NFT6 615 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 ASB11Q8WXH4 323 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 MAL2Q969L2 176 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 OR4K3Q96R72 315 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 RDH8Q9NYR8 311 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 COMMD3Q9UBI1 195 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 PCDHB8Q9UN66 801 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 A0A1W2PRB8 838 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 TRBC2A0A5B9 178 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-208ENST00000441439 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms