RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 TEX26Q8N6G2 289 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC185Q8N715 623 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF114Q8NC26 417 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNH5Q8NCM2 988 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SMRP1Q8NCR6 262 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 OR5AU1Q8NGC0 362 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 C16orf52Q8NHV5 167 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 DPF1Q92782 380 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 COQ2Q96H96 371 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 C10orf90Q96M02 699 aa4.19□□□□□ -1.74
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CBX1P4-201ENST00000439415 ERGIC2Q96RQ1 377 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 CSTL1Q9H114 145 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 EGLN3Q9H6Z9 239 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 FKRPQ9H9S5 495 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNK13Q9HB14 408 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SGK2Q9HBY8 427 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 S100A14Q9HCY8 104 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 FLRT3Q9NZU0 649 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SEC14L3Q9UDX4 400 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 CFAP45Q9UL16 551 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 CDH9Q9ULB4 789 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA1257Q9ULG3 409 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 RIPK3Q9Y572 518 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 LRP6O75581 1613 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 ABCA6Q8N139 1617 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SH3PXD2BA1X283 911 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 MEI4A8MW99 385 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 FPGTO14772 594 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 P2RX6O15547 441 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 ZSCAN12O43309 604 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 NDUFB10O96000 172 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 VTNP04004 478 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 RHOXF2BP0C7M4 288 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 PPIAL4GP0DN37 164 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 UQCRBP14927 111 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 CPN1P15169 458 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 TNFRSF1BP20333 461 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 NT5EP21589 574 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 GAS1P54826 345 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 HERV-K104P61576 105 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 Q0VFX4 171 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SQLEQ14534 574 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 PCK2Q16822 640 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC01620Q4KN68 170 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 LCN1P1Q5VSP4 162 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 C1orf189Q5VU69 101 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 CARD17Q5XLA6 110 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 P4HA3Q7Z4N8 544 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SPRED1Q7Z699 444 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 BIVMQ86UB2 503 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SATL1Q86VE3 508 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SYT14Q8NB59 555 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 OR5D13Q8NGL4 314 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 RDH11Q8TC12 318 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR148Q8TDV2 347 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 RAPGEF5Q92565 580 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 ITFG2Q969R8 447 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 AKR1E2Q96JD6 320 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 UHRF2Q96PU4 802 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 RHOXF2Q9BQY4 288 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 NUP58Q9BVL2 599 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SHARPINQ9H0F6 387 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 POLD4Q9HCU8 107 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 GDF3Q9NR23 364 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 HIF1ANQ9NWT6 349 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 PIPOXQ9P0Z9 390 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 POLKQ9UBT6 870 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SCAPERQ9BY12 1400 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 CFAP74Q9C0B2 1584 aa4.18□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 CKAP5Q14008 2032 aa4.17□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.17□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa4.17□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SH2D1BO14796 132 aa4.17□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SPOPO43791 374 aa4.17□□□□□ -1.74
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