RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 FAM9CQ8IZT9 166 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 LGI4Q8N135 537 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 NELL1Q92832 810 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 KCNJ15Q99712 375 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM43Q9BTV4 400 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 MND1Q9BWT6 205 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 IL20Q9NYY1 176 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 NDUFAF4Q9P032 175 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 QSOX1O00391 747 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 MANBAO00462 879 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 PI15O43692 258 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 PRPS2P11908 318 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 HK1P19367 917 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 MAP2K6P52564 334 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 FGFBP1Q14512 234 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 FCN2Q15485 313 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 MDGA1Q8NFP4 955 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 ST8SIA4Q92187 359 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 UQCC2Q9BRT2 126 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 DOHHQ9BU89 302 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 MED28Q9H204 178 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 NT5DC2Q9H857 520 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 SLC25A19Q9HC21 320 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 EMC7Q9NPA0 242 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 PIAS3Q9Y6X2 628 aa15.96■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 FFAR2O15552 330 aa15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 KCNJ13O60928 360 aa15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ST8SIA6P61647 398 aa15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 DUOXA1Q1HG43 343 aa15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 C9orf64Q5T6V5 341 aa15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ARMC12Q5T9G4 340 aa15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 MEDAGQ5VYS4 303 aa15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM107Q6UX40 140 aa15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 LIPIQ6XZB0 460 aa15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 SYNPOQ8N3V7 929 aa15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 OR52J3Q8NH60 311 aa15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 KCNJ9Q92806 393 aa15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 TSSK3Q96PN8 268 aa15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 FAM129BQ96TA1 746 aa15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 MED18Q9BUE0 208 aa15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 SGK494L7N484 410 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 FPGTO14772 594 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 PRAMEF1O95521 474 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 HBQ1P09105 142 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 SERPINA4P29622 427 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 CRYBA2P53672 197 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 RPA4Q13156 261 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ENPP2Q13822 863 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 NCF4Q15080 339 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF284Q2VY69 593 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 LIPKQ5VXJ0 399 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 OR7G3Q8NG95 312 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 OR4K2Q8NGD2 314 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 USP7Q93009 1102 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 PANX1Q96RD7 426 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ADGRE3Q9BY15 652 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 SUV39H2Q9H5I1 410 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF304Q9HCX3 659 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 WASH6PQ9NQA3 447 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 LEFTY1O75610 366 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 INPP1P49441 399 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ZMYND11Q15326 602 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 C22orf42Q6IC83 251 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 CNIH2Q6PI25 160 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 SBSNQ6UWP8 590 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF730Q6ZMV8 503 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 NANOGP1Q8N7R0 232 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 SPPL2AQ8TCT8 520 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 UCN3Q969E3 161 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 FZD3Q9NPG1 666 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 TRPS1Q9UHF7 1281 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ENOPH1Q9UHY7 261 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 TRIOO75962 3097 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 A0A0A6YYJ9 748 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 TAPBPO15533 448 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ALPIP09923 528 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ZP3P21754 424 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 KELP23276 732 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms