RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 GIMAP4Q9NUV9 329 aa23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 MAT2BQ9NZL9 334 aa23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 ENTPD4Q9Y227 616 aa23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 OSGIN2Q9Y236 505 aa23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 ASPDHA6ND91 283 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 G3V3Y1 287 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 BIRC5O15392 142 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 SEMA7AO75326 666 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 NADKO95544 446 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 HSPA4LO95757 839 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 TACR1P25103 407 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 GSTM5P46439 218 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 GFRALQ6UXV0 394 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 TICAM1Q8IUC6 712 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM26EQ8N5C1 309 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 PSD4Q8NDX1 1056 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 SIMC1Q8NDZ2 872 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 OR7G1Q8NGA0 311 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 EGLN2Q96KS0 407 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 BBS4Q96RK4 519 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 MYNNQ9NPC7 610 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 SEC14L3Q9UDX4 400 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 NPIPA5E9PKD4 350 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 AGFG2O95081 481 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 UNC5CO95185 931 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 DHRS4L1P0CG22 281 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 PCSK2P16519 638 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 DDCP20711 480 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 BGNP21810 368 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 RPL38P63173 70 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 CASP8Q14790 479 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 RNFT1Q5M7Z0 435 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 HHATQ5VTY9 493 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM64Q6YI46 380 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 RTL4Q6ZR62 310 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 RNF165Q6ZSG1 346 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 KAT2AQ92830 837 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRA2Q9H9E1 313 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 TMBIM4Q9HC24 238 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 MIEF1Q9NQG6 463 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 DEPPQ9NTK1 212 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 GIMAP2Q9UG22 337 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 NPIPA1Q9UND3 350 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 POLEQ07864 2286 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 CLEC18AA5D8T8 446 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 NPIPB8E9PQR5 432 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 LSM1O15116 133 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 SERPINE1P05121 402 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 SOX18P35713 384 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 LYPD8Q6UX82 237 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 CLEC18BQ6UXF7 455 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 CLEC18CQ8NCF0 446 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 OR9A2Q8NGT5 310 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 C16orf52Q8NHV5 167 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 C3orf30Q96M34 536 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 EHD3Q9NZN3 535 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF639Q9UID6 485 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 DTX4Q9Y2E6 619 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 AKAP10O43572 662 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 PEX11AO75192 247 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP6AP2O75787 350 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 DUSP8Q13202 625 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 HOMEZQ8IX15 550 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 TAGAPQ8N103 731 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC15A4Q8N697 577 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM13CQ8NE31 585 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 OR52R1Q8NGF1 315 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 OR5M3Q8NGP4 307 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 CLHC1Q8NHS4 586 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 MGARPQ8TDB4 240 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 ADIPOR1Q96A54 375 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 CTHRC1Q96CG8 243 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 SGCZQ96LD1 299 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 TSSK3Q96PN8 268 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-202ENST00000425695 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A0G2JMM0 328 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1W2PPB8 328 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1W2PRS3 328 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM120BA0PK00 339 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 PINLYPA6NC86 204 aa23.07■■□□□ 1.28
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