RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.93□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NRTNQ99748 197 aa8.93□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.93□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MS4A8Q9BY19 250 aa8.93□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NANOGQ9H9S0 305 aa8.93□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC6A20Q9NP91 592 aa8.93□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SERHLQ9NQF3 203 aa8.93□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM184CQ9NVA4 438 aa8.93□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLAMF8Q9P0V8 285 aa8.93□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 STOML1Q9UBI4 398 aa8.93□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLK4Q9Y5K2 254 aa8.93□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GMEB1Q9Y692 573 aa8.93□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A096LPI6 279 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANKDD1BA6NHY2 528 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 INAFM1C9JVW0 142 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H3BNX3 289 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PCDH7O60245 1069 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SCN2BO60939 215 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLEC3AO75596 197 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLHL18O94889 574 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANPEPP15144 967 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PSMB5P28074 263 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PTPN6P29350 595 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPL3P39023 403 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GSTM5P46439 218 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRPC1P48995 793 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARFIP1P53367 373 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RELAQ04206 551 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRC74AQ0VAA2 488 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MYBPHQ13203 477 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDE7AQ13946 482 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KIR2DS3Q14952 304 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PCOLCEQ15113 449 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZIC1Q15915 447 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF425Q6IV72 752 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IKBIPQ70UQ0 350 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COMMD6Q7Z4G1 85 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AMIGO1Q86WK6 493 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KMT5CQ86Y97 462 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANKRD53Q8N9V6 530 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR2L3Q8NG85 312 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR1L3Q8NH93 324 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC22A18Q96BI1 424 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COQ8BQ96D53 544 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MTERF3Q96E29 417 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ITCHQ96J02 903 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EGLN2Q96KS0 407 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPM1MQ96MI6 270 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANKRD27Q96NW4 1050 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TSSK3Q96PN8 268 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR52E6Q96RD3 313 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CGREF1Q99674 301 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACAT2Q9BWD1 397 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 XKR8Q9H6D3 395 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RMND5AQ9H871 391 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MYNNQ9NPC7 610 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 POT1Q9NUX5 634 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SOHLH2Q9NX45 425 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AHSPQ9NZD4 102 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACTR3BQ9P1U1 418 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATP6V1HQ9UI12 483 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MCM8Q9UJA3 840 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FBXL4Q9UKA2 621 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PACSIN3Q9UKS6 424 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 L3MBTL1Q9Y468 752 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AKAP6Q13023 2319 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC88CQ9P219 2028 aa8.92□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa8.91□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.91□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AQP12BA6NM10 295 aa8.91□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H0Y3Z8 333 aa8.91□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H7BY64 318 aa8.91□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBX19O60806 448 aa8.91□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TGFB1P01137 390 aa8.91□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AGXTP21549 392 aa8.91□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CMPK1P30085 196 aa8.91□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AHRP35869 848 aa8.91□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HPCAL1P37235 193 aa8.91□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GSK3BP49841 420 aa8.91□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WNT3P56703 355 aa8.91□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF763Q0D2J5 394 aa8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms