RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF321PQ8N8H1 164 aa7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF615Q8N8J6 731 aa7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2M7Q8NG81 312 aa7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 PAQR8Q8TEZ7 354 aa7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 C16orf78Q8WTQ4 265 aa7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 CTHRC1Q96CG8 243 aa7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 GAL3ST4Q96RP7 486 aa7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 HBEGFQ99075 208 aa7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 HES7Q9BYE0 225 aa7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 OR10A5Q9H207 317 aa7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 IL1RL2Q9HB29 575 aa7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 MYNNQ9NPC7 610 aa7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 UTS2RQ9UKP6 389 aa7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 NPIPA1Q9UND3 350 aa7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 TMED5Q9Y3A6 229 aa7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 ITPR2Q14571 2701 aa7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 RELNP78509 3460 aa7.86□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 TTC36A6NLP5 189 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 FOXO6A8MYZ6 492 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 PRRG2O14669 202 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 BIRC5O15392 142 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 NADKO95544 446 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 IL3P08700 152 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 IFI6P09912 130 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 CHN1P15882 459 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 ABOP16442 354 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 DDCP20711 480 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 AGAP20933 346 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 S1PR1P21453 382 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 DRD5P21918 477 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 SSTR4P31391 388 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 FEN1P39748 380 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 PPICP45877 212 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 ASMTP46597 345 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 HTR6P50406 440 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 SMSP52788 366 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNK10P57789 538 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 PPIAP62937 165 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 RAE1P78406 368 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 HMGCS1Q01581 520 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 PLGLB1Q02325 96 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 BTKQ06187 659 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 C2orf80Q0P641 193 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 MGAT2Q10469 447 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 CEBPEQ15744 281 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 NTRK2Q16620 822 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 HYAL4Q2M3T9 481 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF750Q32MQ0 723 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 LRIG3Q6UXM1 1119 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM47EQ6ZV65 393 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 FBXW8Q8N3Y1 598 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 TCP10LQ8TDR4 215 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 DTNBP1Q96EV8 351 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 APIPQ96GX9 242 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 PKNOX2Q96KN3 472 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF681Q96N22 645 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 BBS4Q96RK4 519 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNA7Q96RP8 456 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 BRINP2Q9C0B6 783 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 LRTM1Q9HBL6 345 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 MIEF1Q9NQG6 463 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 C1orf109Q9NX04 203 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 QPCTLQ9NXS2 382 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 MAT2BQ9NZL9 334 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF639Q9UID6 485 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 ENTPD4Q9Y227 616 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.85□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.84□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 OR14I1A6ND48 311 aa7.84□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 MYO1GB0I1T2 1018 aa7.84□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 E9PLN8 166 aa7.84□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 HRKO00198 91 aa7.84□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 CCL21O00585 134 aa7.84□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 TM9SF1O15321 606 aa7.84□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 TYROBPO43914 113 aa7.84□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 SUSD5O60279 629 aa7.84□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 PLOD3O60568 738 aa7.84□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 HCN1O60741 890 aa7.84□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 TBX19O60806 448 aa7.84□□□□□ -1.15
MT-TS1-201ENST00000387416 ABCB7O75027 752 aa7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms