RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349062.6

TRIM4-201, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 3,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-201ENST00000349062 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 PRSS41Q7RTY9 318 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 P2RY8Q86VZ1 359 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 SETD9Q8NE22 299 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 FAM46DQ8NEK8 389 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 OR13H1Q8NG92 308 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 DNASE1L2Q92874 299 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 QRFPRQ96P65 431 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 HHIPQ96QV1 700 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 ADAP2Q9NPF8 381 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 SLC13A4Q9UKG4 626 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 TMCC3Q9ULS5 477 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 CLDN24A6NM45 220 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 HPRP00739 348 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 EPS8Q12929 822 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 SELENBP1Q13228 472 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 KDM4DQ6B0I6 523 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 AKAP14Q86UN6 197 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 PARGQ86W56 976 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 BMFQ96LC9 184 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 ZNF576Q9H609 170 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 C8orf4Q9NR00 106 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 CA14Q9ULX7 337 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 NTNG1Q9Y2I2 539 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 NPIPA7E9PJI5 369 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 ADAMDEC1O15204 470 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 ASNA1O43681 348 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 GASTP01350 101 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 NPIPA8P0DM63 369 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 DDX5P17844 614 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 DAB2P98082 770 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 RAB30Q15771 203 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 OR4N4Q8N0Y3 316 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 STX19Q8N4C7 294 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 OR5T3Q8NGG3 340 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 COPS4Q9BT78 406 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 MENTQ9BUN1 341 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 IL21RQ9HBE5 538 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 TMEM74BQ9NUR3 256 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 OBP2AQ9NY56 170 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 TPRKBQ9Y3C4 175 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 C2CD4DB7Z1M9 353 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 STSP08842 583 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 C7P10643 843 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 LIM2P55344 173 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 ADAM15Q13444 863 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 GPR18Q14330 331 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 SPATC1Q76KD6 591 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 CLIP3Q96DZ5 547 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 WDR92Q96MX6 357 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 FAIM2Q9BWQ8 316 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 PCBD2Q9H0N5 130 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 TRPV4Q9HBA0 871 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 ENPP5Q9UJA9 477 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 RNF6Q9Y252 685 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 CACNA1CQ13936 2221 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 NPIPB8E9PQR5 432 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 HMGN4O00479 90 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 RGS10O43665 173 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 IFNA14P01570 189 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 MAGEA2P43356 314 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 TUBA3CQ13748 450 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 RFX4Q33E94 735 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 ATAD3BQ5T9A4 648 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 UBE2UQ5VVX9 321 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 ZNF605Q86T29 641 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 OR5P2Q8WZ92 322 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 MS4A6EQ96DS6 147 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 DMRTB1Q96MA1 342 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 TPK1Q9H3S4 243 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 MUC3AQ02505 3323 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIM4-201ENST00000349062 TMEM229AB2RXF0 380 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms