RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 CDCA4Q9BXL8 241 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 CTPS2Q9NRF8 586 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 SCN3AQ9NY46 2000 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 ARRDC5A6NEK1 342 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 C4orf51C9J302 202 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 H1F0P07305 194 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 OSMP13725 252 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 GPR19Q15760 415 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 TPRG1LQ5T0D9 272 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 AGBL4Q5VU57 503 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 OR4C11Q6IEV9 310 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 IQCF1Q8N6M8 205 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 CRELD1Q96HD1 420 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF354BQ96LW1 612 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 BOLA1Q9Y3E2 137 aa15.47■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1W2PS29 197 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 EFCAB10A6NFE3 127 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 GRXCR1A8MXD5 290 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 KIAA0513O60268 411 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 UPK1BO75841 260 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 TSPAN9O75954 239 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 ADAP00813 363 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 RPN2P04844 631 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 GPC1P35052 558 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 SSR2P43308 183 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 CHRNEQ04844 493 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 FGL2Q14314 439 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 SSX1Q16384 188 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 FAM46CQ5VWP2 391 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 TANGO2Q6ICL3 276 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 ATCAYQ86WG3 371 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 LYSMD2Q8IV50 215 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 AMER2Q8N7J2 671 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 CREB3L4Q8TEY5 395 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 SH3D21A4FU49 640 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 OR52A4PA6NMU1 304 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 TBX19O60806 448 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 NME6O75414 186 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 TNNI3P19429 210 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 SLC15A1P46059 708 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 UBE3AQ05086 875 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 STEAP3Q658P3 488 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 PGBD2Q6P3X8 592 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 LSMEM1Q8N8F7 131 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 OR2A1Q8NGT9 310 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 CHFRQ96EP1 664 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 AMDHD1Q96NU7 426 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 CITED4Q96RK1 184 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 CERS4Q9HA82 394 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 SLC25A19Q9HC21 320 aa15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SHQ1-201ENST00000325599 LRIT2A6NDA9 550 aa15.46■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 SNPHO15079 494 aa15.46■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ALX3O95076 343 aa15.46■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 GNG2P59768 71 aa15.46■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ILKQ13418 452 aa15.46■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 MYO9BQ13459 2157 aa15.46■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 IRF4Q15306 451 aa15.46■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF367Q7RTV3 350 aa15.46■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 RAB7BQ96AH8 199 aa15.46■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 QRFPRQ96P65 431 aa15.46■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ENOPH1Q9UHY7 261 aa15.46■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 A4GNTQ9UNA3 340 aa15.46■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 KLHL20Q9Y2M5 609 aa15.46■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 A0A0A6YYD5 115 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1W2PP55 124 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 PGRMC2O15173 223 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 GPX5O75715 221 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 NR2F1P10589 423 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 GJA4P35212 333 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 SOX3P41225 446 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 XKP51811 444 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 DUSP2Q05923 314 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 PARP16Q8N5Y8 322 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 TCEANCQ8N8B7 351 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 KBTBD8Q8NFY9 601 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 SLC35G5Q96KT7 338 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 SLC6A18Q96N87 628 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 PRR14Q9BWN1 585 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 SYNPO2LQ9H987 977 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ANKRA2Q9H9E1 313 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ANKHQ9HCJ1 492 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 MPZL2O60487 215 aa15.45■□□□□ 0.06
SHQ1-201ENST00000325599 KAT7O95251 611 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms