RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 KRT84Q9NSB2 600 aa21.38■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 SEC14L3Q9UDX4 400 aa21.38■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 CEP192Q8TEP8 1941 aa21.38■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 ITGAMP11215 1152 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 CPMP14384 443 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 KCNJ5P48544 419 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 CRISP3P54108 245 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 NR1H2P55055 460 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 KCNC4Q03721 635 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 C14orf28Q4W4Y0 310 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC22Q8N4W6 341 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 OR9A4Q8NGU2 314 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 DOK4Q8TEW6 326 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 WFDC6Q9BQY6 131 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 RHCGQ9UBD6 479 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 MYO15AQ9UKN7 3530 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 B4GAT1O43505 415 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 FGF17O60258 216 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 RDH16O75452 317 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEA8P43361 318 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 MAN2A2P49641 1150 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 NKAIN2Q5VXU1 208 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF605Q86T29 641 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 LGI4Q8N135 537 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 GIPC3Q8TF64 312 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 PROX1Q92786 737 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 TGM7Q96PF1 710 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 YIPF3Q9GZM5 350 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 SPACA6W5XKT8 324 aa21.37■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1B0GVT2 93 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 BCKDKO14874 412 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINB7O75635 380 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 IL7RP16871 459 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 SOX18P35713 384 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 MEP1AQ16819 746 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 GPAT3Q53EU6 434 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF691Q5VV52 312 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 COMTD1Q86VU5 262 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 OR4D11Q8NGI4 311 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 TCTN2Q96GX1 697 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF354BQ96LW1 612 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 PRDM9Q9NQV7 894 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 ACER3Q9NUN7 267 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 MED26O95402 600 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 PORP16435 677 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 RHCEP18577 417 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 EPHA2P29317 976 aa21.36■■□□□ 1.01
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VSTM4-201ENST00000298454 TUBA4AP68366 448 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 CD47Q08722 323 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 RAPSNQ13702 412 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 WDR45BQ5MNZ6 344 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 FEVQ99581 238 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 ANKHQ9HCJ1 492 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 BCL2L10Q9HD36 194 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 RLIMQ9NVW2 624 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 CLCA2Q9UQC9 943 aa21.36■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 FFAR1O14842 300 aa21.35■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 SEMA7AO75326 666 aa21.35■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 ALDH4A1P30038 563 aa21.35■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 ISL1P61371 349 aa21.35■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 BNIP3Q12983 259 aa21.35■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 PRTGQ2VWP7 1150 aa21.35■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 KRT73Q86Y46 540 aa21.35■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 LACC1Q8IV20 430 aa21.35■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa21.35■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 SLC5A8Q8N695 610 aa21.35■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 OR10G2Q8NGC3 310 aa21.35■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 BBS10Q8TAM1 723 aa21.35■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 ACTRT3Q9BYD9 372 aa21.35■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
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VSTM4-201ENST00000298454 A0A087WXM4 84 aa21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 PCDH17O14917 1159 aa21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 MICAQ29983 383 aa21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 RASSF5Q8WWW0 418 aa21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 NCSTNQ92542 709 aa21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 NTMQ9P121 344 aa21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL3Q9UH77 587 aa21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM131Q92545 1883 aa21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 RHPN2P1A8MT19 583 aa21.34■■□□□ 1.01
VSTM4-201ENST00000298454 I3L1I5 382 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
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